RNA–Protein interactions for RNA: YHR006W

STP2, Transcript of Transcription factor, yeast

Gene STP2, Length 1,626 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STP2	YHR006W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	SLS1	P42900	643 aa		4.27	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	DAK2	P43550	591 aa		4.27	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	CIT3	P43635	486 aa		4.27	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	YGR045C	P53229	120 aa		4.27	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	OXR1	Q08952	273 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	NSI1	Q12457	570 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	YTA7	P40340	1379 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	NFS1	P25374	497 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	UGA4	P32837	571 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	NEM1	P38757	446 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	RSM26	P47141	266 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	RCM1	P53972	490 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	PEX13	P80667	386 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	MSH3	P25336	1018 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	SQT1	P35184	431 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	OCA5	P38738	679 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	ALT1	P52893	592 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	SDH1	Q00711	640 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	ULP1	Q02724	621 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	TOS4	Q06266	489 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	RKR1	Q04781	1562 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	TOP1	P04786	769 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	NNK1	P36003	928 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	MGE1	P38523	228 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	PEX28	P38848	579 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	YAR028W	P39548	234 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	EAR1	Q03212	550 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	UFD4	P33202	1483 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	SEA4	P38164	1038 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	BRN1	P38170	754 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	AVT1	P47082	602 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	RPO31	P04051	1460 aa		4.22	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	FAA3	P39002	694 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	XKS1	P42826	600 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	ADI1	Q03677	179 aa		4.21	□□□□□ -1.73
STP2	YHR006W	POL1	P13382	1468 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	ATG14	P38270	344 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	NNF1	P47149	201 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	YVC1	Q12324	675 aa		4.21	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	MCM2	P29469	868 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	YJR107W	P47145	328 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	TPP1	Q03796	238 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	LAP2	Q10740	671 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
STP2	YHR006W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	HSE1	P38753	452 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	VAC8	P39968	578 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	FYV10	P40492	516 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	IRC24	P40580	263 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	YNR063W	P53749	607 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	SVF1	Q05515	481 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	TRE1	Q08919	783 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	STU1	P38198	1513 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	ADP1	P25371	1049 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	SSY1	Q03770	852 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	SPR28	Q04921	423 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	CDC25	P04821	1589 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	LRG1	P35688	1017 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	ADD66	P36040	267 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	MNN4	P36044	1178 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STP2	YHR006W	RDH54	P38086	958 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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