RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C RSC58Q07979 502 aa4.14□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C NOB1Q08444 459 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C SSA4P22202 642 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C MCM5P29496 775 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C RVS167P39743 482 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C NTO1Q12311 748 aa4.13□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C TY1A-DR6P0CX70 440 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C TY1A-ER1P0CX71 440 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C TY1A-LR2P0CX72 440 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C TY1A-PLP0CX73 440 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C TY1A-JR1P0CX74 440 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C TY1A-LR3P0CX75 440 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C TY1A-ML2P0CX76 440 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C DUR3P33413 735 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C BOL3P39724 118 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C MCM6P53091 1017 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C NUT1P53114 1132 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C BSC2Q05611 235 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C RSA3Q05942 220 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C RXT3Q07458 294 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C TY1A-GR1Q12085 440 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C INO80P53115 1489 aa4.11□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C CYC1P00044 109 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C CCZ1P38273 704 aa4.1□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C SEC26P41810 973 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C PBP1P53297 722 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C COQ4O13525 335 aa4.09□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C FLP1P03870 423 aa4.09□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C SLS1P42900 643 aa4.09□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C YNL011CP53980 444 aa4.09□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C SGS1P35187 1447 aa4.09□□□□□ -1.75
GCN4YEL009C EXO5P38289 585 aa4.08□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C DUS4Q06063 367 aa4.08□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C YSC84P32793 468 aa4.07□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C CHS7P38843 316 aa4.07□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C NMD3P38861 518 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C ROT1Q03691 256 aa4.07□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C RSB1Q08417 382 aa4.07□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C YJL045WP47052 634 aa4.06□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C VPS53P47061 822 aa4.06□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C CDC20P26309 610 aa4.05□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C LST4P34239 828 aa4.05□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C NEM1P38757 446 aa4.05□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C QNS1P38795 714 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C RSM24Q03976 319 aa4.05□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C CDC55Q00362 526 aa4.04□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C UTP5Q04177 643 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C TMA10Q06177 86 aa4.04□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C BDF2Q07442 638 aa4.04□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C VMA4P22203 233 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C UBA2P52488 636 aa4.03□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C NOG1Q02892 647 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C PPM2Q08282 695 aa4.03□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C GPB1Q08886 897 aa4.03□□□□□ -1.76
GCN4YEL009C PMA1P05030 918 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C OAR1P35731 278 aa4.02□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C IOC3P43596 787 aa4.02□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C RKM2Q03942 479 aa4.02□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C DCG1P32460 244 aa4.01□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C DEF1P35732 738 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C GLO3P38682 493 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C XKS1P42826 600 aa4.01□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C MNL2Q12205 849 aa4.01□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C TY1B-DR4Q07793 1604 aa4□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C BAP2P38084 609 aa4□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C PIK1P39104 1066 aa4□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C QDR1P40475 563 aa4□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C ACF4P47129 309 aa4□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C PHO23P50947 330 aa4□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C ATG1P53104 897 aa4□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C TNA1P53322 534 aa4□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C HOS3Q02959 697 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C PLB2Q03674 706 aa4□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C TRS120Q04183 1289 aa4□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C INP54Q08227 384 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C RFC5P38251 354 aa3.99□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C SWR1Q05471 1514 aa3.99□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C KIN2P13186 1147 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C MON1P53129 644 aa3.98□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C YNR063WP53749 607 aa3.98□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C GAL10P04397 699 aa3.97□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data3.97□□□□□ -1.77not detected
GCN4YEL009C MSH3P25336 1018 aa3.97□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C MOH1P38191 138 aa3.97□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C MSS4P38994 779 aa3.97□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C ATF1P40353 525 aa3.97□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C KIN4Q01919 800 aa3.97□□□□□ -1.77
GCN4YEL009C CMP2P14747 604 aa3.96□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C KAR5Q04746 504 aa3.96□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C YLR224WQ05947 369 aa3.96□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C SUB2Q07478 446 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C NOP12Q08208 459 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C AIM39Q08223 395 aa3.96□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C ADD66P36040 267 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.9 ms