RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeastyeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC3YJL059W STR2P47164 639 aa8.1□□□□□ -1.11
YHC3YJL059W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
YHC3YJL059W PPM2Q08282 695 aa8.1□□□□□ -1.11
YHC3YJL059W YOR378WQ08902 515 aa8.1□□□□□ -1.11
YHC3YJL059W MTC2P34246 357 aa8.08□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W SNF7P39929 240 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W BDP1P46678 594 aa8.08□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W ISM1P48526 1002 aa8.08□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W CWH41P53008 833 aa8.08□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W ADR1P07248 1323 aa8.07□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W SFP1P32432 683 aa8.07□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W GCD11P32481 527 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W GDE1Q02979 1223 aa8.07□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W OXR1Q08952 273 aa8.07□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W OPI1P21957 404 aa8.06□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W TAT2P38967 592 aa8.06□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W SAM37P50110 327 aa8.06□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W YGR122WP53272 402 aa8.06□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W MEH1Q02205 184 aa8.06□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data8.06□□□□□ -1.12not detected
YHC3YJL059W UBP1P25037 809 aa8.05□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W VPS35P34110 944 aa8.05□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W TFC3P34111 1160 aa8.05□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W AIM9P40053 627 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W HOS4P40480 1083 aa8.05□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W GPI13Q07830 1017 aa8.05□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W ATP4P05626 244 aa8.04□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W PDC1P06169 563 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W CYC8P14922 966 aa8.04□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W NFU1P32860 256 aa8.04□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W KXD1P53158 218 aa8.04□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W CWC22P53333 577 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W MDM1Q01846 1127 aa8.04□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data8.04□□□□□ -1.12not detected
YHC3YJL059W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W SUV3P32580 737 aa8.03□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W JNM1P36224 373 aa8.03□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W MAL31P38156 614 aa8.03□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W VID27P40157 782 aa8.03□□□□□ -1.12
YHC3YJL059W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W PRI2P20457 528 aa8.02□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W IXR1P33417 597 aa8.02□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W UFD2P54860 961 aa8.02□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W FLC1Q08967 793 aa8.02□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TMA17Q12513 150 aa8.02□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W YBT1P32386 1661 aa8.02□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-DR4O74302 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-AP0CX57 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-PR1P0CX58 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-ORP0CX59 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-PR2P0CX60 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-DR5P0CX65 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-ER2P0CX66 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-GR3P0CX67 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-LR1P0CX68 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-MR2P0CX69 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W SEC2P17065 759 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W VAC17P25591 423 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W NTH2P35172 780 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W HAL5P38970 855 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W NIT1P40447 199 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-JR2P47099 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TYW3P53177 273 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-DR1Q03856 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W HDA3Q06623 655 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W RLP24Q07915 199 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-BRQ12217 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-NL2Q12470 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY1A-GR2Q12485 440 aa8.01□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa8□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W INH1P01097 85 aa8□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W CDC11P32458 415 aa8□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W HIR1P32479 840 aa8□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa8□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W CYT1P07143 309 aa7.99□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W SWI3P32591 825 aa7.99□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W NGR1P32831 672 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W YHL008CP38750 627 aa7.99□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W GGA2P38817 585 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W RSP5P39940 809 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W YGR237CP50089 785 aa7.99□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W RPL8AP17076 256 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W YAP1801P38856 637 aa7.98□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W PAC1P39946 494 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W BRE2P43132 505 aa7.98□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W HXT10P43581 546 aa7.98□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W FAA4P47912 694 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W HLJ1P48353 224 aa7.98□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W SND1Q04007 877 aa7.98□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W SPO75Q07798 868 aa7.98□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W OPI10Q08202 246 aa7.98□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W REC8Q12188 680 aa7.98□□□□□ -1.13
YHC3YJL059W OSH2Q12451 1283 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.5 ms