RNA–Protein interactions for RNA: YHR109W

CTM1, Transcript of Cytochrome c lysine methyltransferase, yeast

Gene CTM1, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTM1	YHR109W	CAN1	P04817	590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	RER2	P35196	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	VBA5	P36172	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	PMT7	Q06644	662 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	SPO75	Q07798	868 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	DAL1	P32375	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	ASH1	P34233	588 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	APM2	P38700	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	UBP12	P39538	1254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	FMP25	Q08023	583 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	CIT1	P00890	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	RGP1	P16664	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	NPR1	P22211	790 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	AMS1	P22855	1083 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	MSH3	P25336	1018 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	ARE1	P25628	610 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	EAF1	Q06337	982 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	GAL11	P19659	1081 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	RIM11	P38615	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	HXT13	P39924	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	SAP155	P43612	1002 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	SKP1	P52286	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	HXT17	P53631	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	HST3	P53687	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	HXT15	P54854	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	ROD1	Q02805	837 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	ADR1	P07248	1323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	RAS1	P01119	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	AGP1	P25376	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	YJL181W	P46987	611 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	PFD1	P46988	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	PPT1	P53043	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	SPO20	Q04359	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	SRF1	Q12516	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	AFT1	P22149	690 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
CTM1	YHR109W	IRR1	P40541	1150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	RTA1	P53047	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	LYP1	P32487	611 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	MRP8	P35719	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	MRPL16	P38064	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	ALR2	P43553	858 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	YJR098C	P47139	656 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	SIW14	P53965	281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	SHE9	Q04172	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	NTG2	Q08214	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	INO1	P11986	533 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	MBP1	P39678	833 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	YGL081W	P53156	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	ERP6	P53198	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	TAF8	Q03750	510 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	CDC4	P07834	779 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	BET3	P36149	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	HUL4	P40985	892 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	GLO4	Q12320	285 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	IDI1	P15496	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	RDH54	P38086	958 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	VTC4	P47075	721 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	FOL1	P53848	824 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	FUS1	P11710	512 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	MSH2	P25847	964 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	MKK2	P32491	506 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	GRX7	P38068	203 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	PBY1	P38254	753 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	EXO5	P38289	585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	YJR124C	P47159	448 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	LSC2	P53312	427 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTM1	YHR109W	SFP1	P32432	683 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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