RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.8■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 MED14O60244 1454 aa16.8■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.8■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.8■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.8■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.79■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 PHACTR3Q96KR7 559 aa16.79■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.79■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.79■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 ZSCAN30Q86W11 494 aa16.79■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.79■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 NME9Q86XW9 330 aa16.79■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 METP08581 1390 aa16.78■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 CCDC173Q0VFZ6 552 aa16.78■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NISCH-212ENST00000488380 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 AAMPQ13685 434 aa16.77■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.77■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.76■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 GOLGA6L22H0YM25 854 aa16.76■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHG5O94827 1062 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 OFD1O75665 1012 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 FCHSD2O94868 740 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 WASLO00401 505 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 AGLP35573 1532 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 IL16Q14005 1332 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 TSPYL6Q8N831 410 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 ATP7BP35670 1465 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 DLC1Q96QB1 1528 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 RAB3GAP1Q15042 981 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 CPS1P31327 1500 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-212ENST00000488380 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 LNPKQ9C0E8 428 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 REREQ9P2R6 1566 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 NUTM2FA1L443 756 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 SSFA2P28290 1259 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB7CA1YPR0 619 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 SMC5Q8IY18 1101 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 PTMSP20962 102 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 IL13P35225 146 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 ZMYM3Q14202 1370 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 FAM83GA6ND36 823 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R9BQ96SB3 815 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 UQCRHLA0A096LP55 91 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 UQCRHP07919 91 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 NFE2L2Q16236 605 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 PRR36Q9H6K5 1346 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 DDIT3P35638 169 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 DCTN1Q14203 1278 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 SNX21Q969T3 373 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 PRDM4Q9UKN5 801 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 MAP7D2Q96T17 732 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 KIF16BQ96L93 1317 aa16.66■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 MCTP1Q6DN14 999 aa16.66■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 MBIPQ9NS73 344 aa16.66■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 VAMP4O75379 141 aa16.65■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 RBM25P49756 843 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 COG3Q96JB2 828 aa16.65■□□□□ 0.26
NISCH-212ENST00000488380 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.64■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 DLG5Q8TDM6 1919 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 BAG4O95429 457 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 C8orf58Q8NAV2 365 aa16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms