RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C CBP1P07252 654 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C FBP1P09201 348 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C TRL1P09880 827 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MPH3P0CE00 602 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C GAL2P13181 574 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data0.85□□□□□ -2.27not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C SDH2P21801 266 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PRE8P23639 250 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ADP1P25371 1049 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PER1P25625 357 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C CHS3P29465 1165 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PRO3P32263 286 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C TGL1P34163 548 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ASH1P34233 588 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data0.85□□□□□ -2.27not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C OCT1P35999 772 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C DBP7P36120 742 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C BOI1P38041 980 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C POA1P38218 177 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C TPS3P38426 1054 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C VPS29P38759 282 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RSC30P38781 883 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RTS1P38903 757 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C GPB2P39717 880 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C AFG3P39925 761 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MXR1P40029 184 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C AIM9P40053 627 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ATG32P40458 529 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YIR014WP40570 242 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YIR042CP40586 236 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C SPR3P41901 512 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C GSM1P42950 618 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C BDP1P46678 594 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C IRC8P47046 822 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YJL007CP47080 104 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MLC1P53141 149 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C SOL4P53315 255 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ALD6P54115 500 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C GCR2Q01722 534 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C TRM44Q02648 567 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C GDE1Q02979 1223 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PUF6Q04373 656 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C INM2Q05533 292 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR407WQ06070 228 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PIB1Q06651 286 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ECM30Q06673 1274 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C BRE1Q07457 700 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C GUD1Q07729 489 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL260WQ08977 551 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RAD61Q99359 647 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PDR18P53756 1333 aa0.85□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PMA1P05030 918 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data0.84□□□□□ -2.27not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C ERG12P07277 443 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C NUC1P08466 329 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RAD18P10862 487 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C KRS1P15180 591 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data0.84□□□□□ -2.27not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C CBP3P21560 335 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MAK31P23059 88 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PKC1P24583 1151 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C SCJ1P25303 377 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC60P26637 1090 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PEP3P27801 918 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RME1P32338 300 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ANP1P32629 500 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C SLA1P32790 1244 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C UGA4P32837 571 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C BCS1P32839 456 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C TIM23P32897 222 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C IXR1P33417 597 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MAC1P35192 417 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C TFA1P36100 482 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MET1P36150 593 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C BRN1P38170 754 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YBL028CP38202 106 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C CST26P38226 397 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PBY1P38254 753 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PHO88P38264 188 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C OPY1P38271 328 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ERG7P38604 731 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RFC1P38630 861 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C STB5P38699 743 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C NMD2P38798 1089 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C TOM71P38825 639 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C UBP9P39967 754 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C VAB2P40003 282 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RRD1P40454 393 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C SPO22P40511 975 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PIP2P52960 996 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RET3P53600 189 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C FOL1P53848 824 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C HDA1P53973 706 aa0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS15Q01855 142 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.8 ms