RNA–Protein interactions for RNA: YOR160W

MTR10, Transcript of Nuclear import receptor, yeast

Gene MTR10, Length 2,919 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR10	YOR160W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	PAH1	P32567	862 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	ERG7	P38604	731 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	GYP7	P48365	746 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	FMP30	Q02883	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	VPS64	Q03944	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	HO	P09932	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	DIT2	P21595	489 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	SGD1	Q06132	899 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	SPC110	P32380	944 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	ERP2	P39704	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	YGL081W	P53156	320 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	UBX5	Q06682	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	ITC1	P53125	1264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	JIP4	Q03361	876 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	BLI1	P35727	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	ULP1	Q02724	621 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	THI3	Q07471	609 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	ICL2	Q12031	575 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	TOM20	P35180	183 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	ZDS2	P54786	942 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	IRC4	Q03036	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	PKH1	Q03407	766 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	SLD2	P34252	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	FIR1	P40020	876 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	PSF2	P40359	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	IES1	P43579	692 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	YAF9	P53930	226 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	FCP1	Q03254	732 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	RCF1	Q03713	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	MRP7	P12687	371 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	RAD53	P22216	821 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	LDH1	P38139	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	JJJ2	P46997	583 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	VPS62	P53285	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	SRC1	Q03707	834 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	DJP1	P40564	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	TOS4	Q06266	489 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	MCM1	P11746	286 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
MTR10	YOR160W	OPI1	P21957	404 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	RAD51	P25454	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	OCT1	P35999	772 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	MXR1	P40029	184 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	THI22	Q06490	572 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	ECM29	P38737	1868 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	KIN1	P13185	1064 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	YFH7	P43591	353 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	NPR3	P38742	1146 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	APL6	P46682	809 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	SNF3	P10870	884 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	VAB2	P40003	282 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	RSM7	P47150	247 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	PCL8	Q08966	492 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	GSM1	P42950	618 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	SRT1	Q03175	343 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	PER1	P25625	357 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	NUP133	P36161	1157 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	LYS14	P40971	790 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	TAF1	P46677	1066 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	PUS6	P53294	404 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTR10	YOR160W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	RRN6	P32786	894 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	NPL4	P33755	580 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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