RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	HXT5	P38695	592 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	ERC1	P38767	581 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	SPC72	P39723	622 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	HOP2	P53187	214 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	FUS2	Q05670	677 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	ESC2	Q06340	456 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	HIR3	P47171	1648 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	SEN2	P16658	377 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	PTC4	P38089	393 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.23	□□□□□ -1.57	not detected
SFI1	YLL003W	IRR1	P40541	1150 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	ESP1	Q03018	1630 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	MHP1	P43638	1398 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	TSR4	P25040	408 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	UGA3	P26370	528 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	DLD1	P32891	587 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	BCK2	P33306	851 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	TBS1	P38114	1094 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	DSF2	P38213	736 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	PRE3	P38624	215 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	MEF2	P39677	819 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	YDL129W	Q07555	291 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	CDC45	Q08032	650 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	SLP1	Q12232	587 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.22	□□□□□ -1.57	not detected
SFI1	YLL003W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	ESL2	P36168	1195 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	CCL1	P37366	393 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	TAF2	P23255	1407 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	DNM1	P54861	757 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	MRS2	Q01926	470 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	INP2	Q03824	705 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	SPO71	Q03868	1245 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	ECM11	Q04110	302 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	YOL057W	Q08225	711 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SFI1	YLL003W	TSC11	P40061	1430 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	SPS1	P08458	490 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	ANP1	P32629	500 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	MRE11	P32829	692 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	SSO1	P32867	290 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	UIP5	P36137	443 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	SAP30	P38429	201 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	SIT1	P39980	628 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	NNF1	P47149	201 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	NNT1	Q05874	261 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	KIN1	P13185	1064 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	PMS1	P14242	873 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	YRO2	P38079	344 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	HSM3	P38348	480 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	VPS41	P38959	992 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	MET12	P46151	657 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	PEX21	P50091	288 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	MRPL25	P23369	157 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	ATG19	P35193	415 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	MRP8	P35719	219 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	YEL023C	P39992	682 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	MAM1	P40065	302 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	RTP1	Q12751	981 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	RTC1	Q08281	1341 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	YOR1	P53049	1477 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	HNM1	P19807	563 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	RRN6	P32786	894 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	PEP12	P32854	288 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	NUP84	P52891	726 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	MPC54	Q08550	464 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	ACE2	P21192	770 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	NUP120	P35729	1037 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	CAJ1	P39101	391 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SFI1	YLL003W	RTT106	P40161	455 aa		5.19	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 87.8 ms