RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	VPS4	P52917	437 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SYF2	YGR129W	GCR2	Q01722	534 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SYF2	YGR129W	HED1	Q03937	162 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SYF2	YGR129W	CSR2	Q12734	1121 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SYF2	YGR129W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
SYF2	YGR129W	MAL31	P38156	614 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SYF2	YGR129W	RGA1	P39083	1007 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SYF2	YGR129W	HKR1	P41809	1802 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SYF2	YGR129W	MOD5	P07884	428 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SYF2	YGR129W	ARG8	P18544	423 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SYF2	YGR129W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SYF2	YGR129W	PNT1	P38969	423 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SYF2	YGR129W	HAT1	Q12341	374 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	AFG2	P32794	780 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	NTH2	P35172	780 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	STV1	P37296	890 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	RSC30	P38781	883 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	CRF1	Q04930	467 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	GAS5	Q08193	484 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	GSC2	P40989	1895 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	YPR204W	Q08995	1032 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	LYS2	P07702	1392 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	SLY41	P22215	453 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	KXD1	P53158	218 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SYF2	YGR129W	VPS13	Q07878	3144 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	UGA3	P26370	528 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	MET32	Q12041	191 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	YPR117W	Q06116	2489 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	RBA50	Q04418	439 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	CBP1	P07252	654 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	KRE2	P27809	442 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	ASH1	P34233	588 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	NSE3	Q05541	303 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.54	□□□□□ -1.2	RIP-Chip
SYF2	YGR129W	HST3	P53687	447 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	HXT10	P43581	546 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	ATF2	P53296	535 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	TBF1	Q02457	562 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	VPS64	Q03944	604 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	PDS5	Q04264	1277 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	RGA2	Q06407	1009 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	TAO3	P40468	2376 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SYF2	YGR129W	FBP1	P09201	348 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	AFT1	P22149	690 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	TPD3	P31383	635 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	GSM1	P42950	618 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	YPL062W	Q02781	134 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	UBX2	Q04228	584 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	FLO11	P08640	1367 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	SCJ1	P25303	377 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	ICP55	P40051	511 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	HST2	P53686	357 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	ZDS2	P54786	942 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	SGD1	Q06132	899 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	DPH6	Q12429	685 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	MET22	P32179	357 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	YDL206W	Q12424	762 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	MTC3	P53077	123 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	PUS6	P53294	404 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	YNL050C	P53952	270 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	ALR1	Q08269	859 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	PAH1	P32567	862 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	SPL2	P38839	148 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	SPR3	P41901	512 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	RPA14	P50106	137 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	ULP1	Q02724	621 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	MMP1	Q12372	583 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	NIT1	P40447	199 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	FCP1	Q03254	732 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	PKH1	Q03407	766 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SYF2	YGR129W	GAL2	P13181	574 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	YDR444W	Q04093	687 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	YPR097W	Q06839	1073 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	ESS1	P22696	170 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	KIP2	P28743	706 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	DLD1	P32891	587 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	PSF2	P40359	213 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	TOS4	Q06266	489 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	COQ4	O13525	335 aa		7.43	□□□□□ -1.22

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