RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 FAM212AQ96EL1 285 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 USP21Q9UK80 565 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-217ENST00000550044 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-217ENST00000550044 NUBP1P53384 320 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-217ENST00000550044 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-217ENST00000550044 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-217ENST00000550044 OCEL1Q9H607 264 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-217ENST00000550044 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
CS-217ENST00000550044 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
CS-217ENST00000550044 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-217ENST00000550044 E9PCH4 1651 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-217ENST00000550044 FKBP8Q14318 412 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-217ENST00000550044 ATRNO75882 1429 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-217ENST00000550044 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-217ENST00000550044 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 LAMC1P11047 1609 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 PTCH1Q13635 1447 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 CCDC125Q86Z20 511 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 LRP5O75197 1615 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 METP08581 1390 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 MARVELD3Q96A59 401 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-217ENST00000550044 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 MYOM2P54296 1465 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 ORAI2Q96SN7 254 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 HRCP23327 699 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 GLI3P10071 1580 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 RGL3Q3MIN7 710 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 CLTCL1P53675 1640 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-217ENST00000550044 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 EMP3P54852 163 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 PXDNQ92626 1479 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 PYGBP11216 843 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 SLIT2O94813 1529 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 GOLGA2Q08379 1002 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 KIF1BO60333 1816 aa14.08□□□□□ -0.15
CS-217ENST00000550044 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 USP32Q8NFA0 1604 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 FOXO3O43524 673 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 BAG6P46379 1132 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 A0A0G2JS52 829 aa14.03□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 NUTM2FA1L443 756 aa14.03□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 MYT1Q01538 1121 aa14.03□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.03□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.02□□□□□ -0.16
CS-217ENST00000550044 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 YY1P25490 414 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 VPS72Q15906 364 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 FAM205CA6NFA0 338 aa14□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 ABCA3Q99758 1704 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 KIF1AQ12756 1690 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 DCAF11Q8TEB1 546 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 PPLO60437 1756 aa13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms