RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051454.3

Fam171b-201, Transcript of Protein FAM171B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Fam171b, Length 5,614 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Polr3aB2RXC6 1390 aa20.66■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 BC005561E9Q5E2 1589 aa20.66■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 TnnQ80Z71 1560 aa20.66■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Emilin2Q8K482 1074 aa20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Jmjd4Q8BFT6 427 aa20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Bicdl1A0JNT9 577 aa20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 OptnQ8K3K8 584 aa20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cetn4Q8K4K1 168 aa20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Prex2Q3LAC4 1598 aa20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Adam1bQ8R534 806 aa20.64■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Atl3Q91YH5 541 aa20.64■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hap1O35668 628 aa20.64■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ggnbp2Q5SV77 696 aa20.64■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 St18Q80TY4 1045 aa20.64■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Slc5a1Q8C3K6 665 aa20.64■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rusc2Q80U22 1514 aa20.64■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 PrxO55103 1391 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Exoc5Q3TPX4 708 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 VgfQ0VGU4 617 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Dixdc1Q80Y83 711 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Slx4Q6P1D7 1565 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hmox1P14901 289 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Krt82Q99M74 516 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pank1Q8K4K6 548 aa20.62■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa20.62■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Adgrl3Q80TS3 1537 aa20.62■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ttc19Q8CC21 365 aa20.62■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Q9D2X8 372 aa20.61■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Plcd4Q8K3R3 807 aa20.61■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 ArsiQ32KI9 573 aa20.61■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 KinQ8K339 391 aa20.61■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa20.61■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ell2Q3UKU1 639 aa20.6■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ttc5Q99LG4 440 aa20.6■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa20.6■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Lmod3E9QA62 571 aa20.59■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Mcm2P97310 904 aa20.59■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cfap74Q3UY96 1578 aa20.59■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ccne1Q61457 408 aa20.58■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 TnikP83510 1323 aa20.58■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Dzip1Q8BMD2 852 aa20.58■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pde4dQ01063 747 aa20.57■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 NpatQ8BMA5 1420 aa20.57■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Naip6Q9JIB6 1403 aa20.56■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa20.56■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cplx1P63040 134 aa20.56■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ehmt1Q5DW34 1296 aa20.56■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nap1l3Q794H2 544 aa20.56■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Atp7aQ64430 1491 aa20.55■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Agtpbp1Q641K1 1218 aa20.55■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa20.55■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa20.54■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Sos1Q62245 1319 aa20.54■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nphp1Q9QY53 687 aa20.54■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Exoc6bA6H5Z3 810 aa20.54■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Washc4Q3UMB9 1173 aa20.53■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa20.53■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Abl1P00520 1123 aa20.53■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Zkscan2G3X952 960 aa20.53■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Fkbp5Q64378 456 aa20.53■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa20.53■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Me1P06801 572 aa20.52■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Naip7Q9JIB3 1402 aa20.52■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Strn4P58404 760 aa20.52■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Kcnh8P59111 1102 aa20.51■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rsph3aQ3UFY4 516 aa20.51■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Talpid3E9PV87 1520 aa20.5■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ipo9Q91YE6 1041 aa20.5■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Stk3Q9JI10 497 aa20.49■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 SkilQ60665 675 aa20.49■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Phactr2B1AVP0 632 aa20.48■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cchcr1Q8K2I2 770 aa20.48■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gsdma2Q32M21 443 aa20.48■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Odf2lQ9D478 642 aa20.48■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 A0A1L1SQF0 893 aa20.47■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ankrd13dQ6PD24 605 aa20.47■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hoxb7P09024 217 aa20.47■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cwc27Q3TKY6 469 aa20.47■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Magi3Q9EQJ9 1476 aa20.47■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Casq1O09165 405 aa20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gli2Q0VGT2 1544 aa20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 EappQ5BU09 281 aa20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Erich6bQ9D4S6 220 aa20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hoxa7P02830 229 aa20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 148 ms