Protein–RNA interactions for Protein: Q32M21

Gsdma2, Gasdermin-A2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdma2Q32M21 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.35■■■■■ 5.01
Gsdma2Q32M21 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Gsdma2Q32M21 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Gsdma2Q32M21 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Gsdma2Q32M21 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
Gsdma2Q32M21 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Gsdma2Q32M21 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.03■■■■■ 4
Gsdma2Q32M21 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
Gsdma2Q32M21 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Gsdma2Q32M21 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Gsdma2Q32M21 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Gsdma2Q32M21 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Gsdma2Q32M21 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Gsdma2Q32M21 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Gsdma2Q32M21 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Gsdma2Q32M21 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Gsdma2Q32M21 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Gsdma2Q32M21 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Gsdma2Q32M21 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Gsdma2Q32M21 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Gsdma2Q32M21 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Gsdma2Q32M21 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Gsdma2Q32M21 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Gsdma2Q32M21 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Gsdma2Q32M21 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Gsdma2Q32M21 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Gsdma2Q32M21 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Gsdma2Q32M21 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Gsdma2Q32M21 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Gsdma2Q32M21 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Gsdma2Q32M21 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Gsdma2Q32M21 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Gsdma2Q32M21 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Gsdma2Q32M21 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Gsdma2Q32M21 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Gsdma2Q32M21 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Gsdma2Q32M21 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Gsdma2Q32M21 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Gsdma2Q32M21 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Gsdma2Q32M21 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Gsdma2Q32M21 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gsdma2Q32M21 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Gsdma2Q32M21 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gsdma2Q32M21 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Gsdma2Q32M21 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Gsdma2Q32M21 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Gsdma2Q32M21 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Gsdma2Q32M21 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Gsdma2Q32M21 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Gsdma2Q32M21 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Gsdma2Q32M21 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Gsdma2Q32M21 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Gsdma2Q32M21 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Gsdma2Q32M21 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Gsdma2Q32M21 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gsdma2Q32M21 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gsdma2Q32M21 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Gsdma2Q32M21 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Gsdma2Q32M21 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Gsdma2Q32M21 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Gsdma2Q32M21 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Gsdma2Q32M21 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Gsdma2Q32M21 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Gsdma2Q32M21 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Gsdma2Q32M21 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Gsdma2Q32M21 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Gsdma2Q32M21 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Gsdma2Q32M21 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Gsdma2Q32M21 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Gsdma2Q32M21 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Gsdma2Q32M21 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Gsdma2Q32M21 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Gsdma2Q32M21 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Gsdma2Q32M21 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Gsdma2Q32M21 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Gsdma2Q32M21 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Gsdma2Q32M21 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Gsdma2Q32M21 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Gsdma2Q32M21 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Gsdma2Q32M21 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Gsdma2Q32M21 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Gsdma2Q32M21 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Gsdma2Q32M21 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Gsdma2Q32M21 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Gsdma2Q32M21 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Gsdma2Q32M21 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gsdma2Q32M21 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Gsdma2Q32M21 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Gsdma2Q32M21 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Gsdma2Q32M21 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gsdma2Q32M21 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Gsdma2Q32M21 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Gsdma2Q32M21 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Gsdma2Q32M21 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Gsdma2Q32M21 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Gsdma2Q32M21 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Gsdma2Q32M21 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Gsdma2Q32M21 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Gsdma2Q32M21 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Gsdma2Q32M21 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms