Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.59■■■■■ 4.73
Zkscan2G3X952 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Zkscan2G3X952 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Zkscan2G3X952 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Zkscan2G3X952 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Zkscan2G3X952 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Zkscan2G3X952 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Zkscan2G3X952 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Zkscan2G3X952 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Zkscan2G3X952 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
Zkscan2G3X952 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Zkscan2G3X952 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Zkscan2G3X952 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Zkscan2G3X952 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Zkscan2G3X952 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Zkscan2G3X952 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Zkscan2G3X952 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Zkscan2G3X952 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Zkscan2G3X952 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Zkscan2G3X952 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Zkscan2G3X952 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Zkscan2G3X952 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Zkscan2G3X952 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Zkscan2G3X952 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Zkscan2G3X952 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Zkscan2G3X952 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Zkscan2G3X952 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Zkscan2G3X952 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Zkscan2G3X952 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Zkscan2G3X952 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Zkscan2G3X952 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Zkscan2G3X952 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Zkscan2G3X952 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Zkscan2G3X952 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Zkscan2G3X952 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Zkscan2G3X952 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Zkscan2G3X952 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Zkscan2G3X952 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Zkscan2G3X952 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Zkscan2G3X952 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Zkscan2G3X952 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Zkscan2G3X952 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Zkscan2G3X952 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Zkscan2G3X952 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Zkscan2G3X952 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Zkscan2G3X952 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Zkscan2G3X952 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Zkscan2G3X952 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Zkscan2G3X952 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Zkscan2G3X952 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Zkscan2G3X952 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Zkscan2G3X952 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Zkscan2G3X952 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Zkscan2G3X952 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Zkscan2G3X952 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Zkscan2G3X952 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Zkscan2G3X952 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Zkscan2G3X952 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Zkscan2G3X952 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Zkscan2G3X952 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Zkscan2G3X952 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Zkscan2G3X952 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Zkscan2G3X952 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Zkscan2G3X952 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Zkscan2G3X952 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Zkscan2G3X952 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Zkscan2G3X952 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Zkscan2G3X952 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Zkscan2G3X952 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Zkscan2G3X952 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Zkscan2G3X952 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Zkscan2G3X952 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Zkscan2G3X952 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Zkscan2G3X952 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Zkscan2G3X952 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Zkscan2G3X952 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Zkscan2G3X952 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Zkscan2G3X952 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Zkscan2G3X952 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Zkscan2G3X952 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Zkscan2G3X952 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Zkscan2G3X952 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Zkscan2G3X952 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Zkscan2G3X952 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Zkscan2G3X952 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Zkscan2G3X952 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Zkscan2G3X952 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Zkscan2G3X952 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Zkscan2G3X952 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Zkscan2G3X952 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Zkscan2G3X952 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Zkscan2G3X952 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Zkscan2G3X952 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Zkscan2G3X952 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Zkscan2G3X952 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Zkscan2G3X952 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Zkscan2G3X952 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Zkscan2G3X952 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Zkscan2G3X952 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Zkscan2G3X952 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms