RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	EAF6	P47128	113 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DDR2	YOL052C-A	PIB2	P53191	635 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DDR2	YOL052C-A	HXT17	P53631	564 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DDR2	YOL052C-A	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
DDR2	YOL052C-A	NPL4	P33755	580 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DDR2	YOL052C-A	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
DDR2	YOL052C-A	PSF3	Q12146	194 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DDR2	YOL052C-A	GRX6	Q12438	231 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DDR2	YOL052C-A	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
DDR2	YOL052C-A	HKR1	P41809	1802 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDR2	YOL052C-A	FIG2	P25653	1609 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDR2	YOL052C-A	GEF1	P37020	779 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDR2	YOL052C-A	IRC4	Q03036	179 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDR2	YOL052C-A	CYB2	P00175	591 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	BBC1	P47068	1157 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	KIN4	Q01919	800 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	PCT1	P13259	424 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	YKU70	P32807	602 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	INM2	Q05533	292 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	RLF2	Q12495	606 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	IOC3	P43596	787 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	JJJ2	P46997	583 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	TAH18	Q12181	623 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	IME2	P32581	645 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	SPO22	P40511	975 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	YIR042C	P40586	236 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	YFH7	P43591	353 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	KAR5	Q04746	504 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	IRC8	P47046	822 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	LAM4	P38800	1345 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDR2	YOL052C-A	SRS2	P12954	1174 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	MET1	P36150	593 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	GRX7	P38068	203 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	SET4	P42948	560 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	DPL1	Q05567	589 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.74	□□□□□ -0.37	not detected
DDR2	YOL052C-A	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	SHC1	P39000	512 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	TOS4	Q06266	489 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	ARG82	P07250	355 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	SNF3	P10870	884 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	12.71	□□□□□ -0.37	not detected
DDR2	YOL052C-A	PPM2	Q08282	695 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
DDR2	YOL052C-A	PEP3	P27801	918 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	MDL2	P33311	773 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	GAS5	Q08193	484 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	COQ1	P18900	473 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	GSM1	P42950	618 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	APL6	P46682	809 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	PIP2	P52960	996 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	VPS20	Q04272	221 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	TOP1	P04786	769 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	IMP2'	P32351	346 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	SIS2	P36024	562 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	RTS1	P38903	757 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	PUS6	P53294	404 aa		12.67	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	CRF1	Q04930	467 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	PSK2	Q08217	1101 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	MSM1	P22438	575 aa		12.65	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	ARP5	P53946	755 aa		12.65	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	ATG20	Q07528	640 aa		12.65	□□□□□ -0.38
DDR2	YOL052C-A	AFG2	P32794	780 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	RER2	P35196	286 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	NPA3	P47122	385 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	YPL260W	Q08977	551 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	FBP26	P32604	452 aa		12.63	□□□□□ -0.39

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