RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W AAP1P37898 856 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W SSP1P38871 571 aa5.5□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W EPS1P40557 701 aa5.5□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W BRE1Q07457 700 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W RIM20Q12033 661 aa5.5□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W TRL1P09880 827 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W YNL193WP53870 558 aa5.49□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W YNL011CP53980 444 aa5.49□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W QCR6P00127 147 aa5.49□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W YBL086CP38177 466 aa5.49□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W ALD2P47771 506 aa5.49□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W PIL1P53252 339 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W POM152P39685 1337 aa5.48□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W TAF13P11747 167 aa5.48□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W KTR1P27810 393 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W GTT3P39996 337 aa5.48□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W YGR130CP53278 816 aa5.48□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W FAR11P53917 953 aa5.48□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W ALD3P54114 506 aa5.48□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W FIG2P25653 1609 aa5.48□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W GLO3P38682 493 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W HAL5P38970 855 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W BDF2Q07442 638 aa5.47□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W SRS2P12954 1174 aa5.47□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W NGR1P32831 672 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W GEF1P37020 779 aa5.47□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W THI3Q07471 609 aa5.47□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W ICP55P40051 511 aa5.47□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W SPT21P35209 758 aa5.46□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W HPC2Q01448 625 aa5.46□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W DPH6Q12429 685 aa5.46□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W HKR1P41809 1802 aa5.46□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W MGM1P32266 881 aa5.46□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data5.46□□□□□ -1.54not detected
YMR196WYMR196W AIM9P40053 627 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W SPL2P38839 148 aa5.45□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W RNR2P09938 399 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W PDR1P12383 1068 aa5.45□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W CAF20P12962 161 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W AIM21P40563 679 aa5.45□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W LAM4P38800 1345 aa5.45□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W PBY1P38254 753 aa5.45□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W OSH3P38713 996 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W STM1P39015 273 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W BBC1P47068 1157 aa5.45□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W CWH41P53008 833 aa5.45□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W VPS24P36095 224 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W YMR147WP40218 223 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W NPA3P47122 385 aa5.44□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W SRC1Q03707 834 aa5.44□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W PIF1P07271 859 aa5.44□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W PRI1P10363 409 aa5.44□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W FRD1P32614 470 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W UGA2P38067 497 aa5.44□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W PFF1P38244 976 aa5.44□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W RPT2P40327 437 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W DJP1P40564 432 aa5.44□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W VPS4P52917 437 aa5.44□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W RRI2Q12348 645 aa5.44□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W SIT4P20604 311 aa5.43□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W OPI1P21957 404 aa5.43□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W TY4A-JP47023 414 aa5.43□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W SPC110P32380 944 aa5.43□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W SNF7P39929 240 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W VPS20Q04272 221 aa5.43□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W KAR5Q04746 504 aa5.43□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W KRE2P27809 442 aa5.43□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W SEC20P28791 383 aa5.43□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W SMY1P32364 656 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W EAF7P53911 425 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W ROX1P25042 368 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W PEA2P40091 420 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W YIR042CP40586 236 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W RPT4P53549 437 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W IRC3Q06683 689 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W LCB1P25045 558 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W SPC42P36094 363 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W SPO22P40511 975 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W ERO1Q03103 563 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W MSP1P28737 362 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W CDC11P32458 415 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W ERT1P38140 529 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W HOS4P40480 1083 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W IRC4Q03036 179 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W SAS4Q04003 481 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W GRX7P38068 203 aa5.41□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W CIC1P38779 376 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W INM2Q05533 292 aa5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 74.9 ms