RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	REV3	P14284	1504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	CYT1	P07143	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	MET22	P32179	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	ERP2	P39704	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	YJR098C	P47139	656 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	OPT2	Q06593	877 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	GAS4	Q08271	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	MMS22	Q06164	1454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	SUM1	P46676	1062 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	ROM1	P53046	1155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	ALG12	P53730	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	TCB1	Q12466	1186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	TAF2	P23255	1407 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PAM18	YLR008C	CIT2	P08679	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	ATE1	P16639	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	BOI2	P39969	1040 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	UBP2	Q01476	1272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	SSK2	P53599	1579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	SWR1	Q05471	1514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	VAN1	P23642	535 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	SEC20	P28791	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	DNM1	P54861	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	SCW11	P53189	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	SVF1	Q05515	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	NHA1	Q99271	985 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	DAL5	P15365	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	GRX4	P32642	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	SSN3	P39073	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	POL32	P47110	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	TRS33	Q99394	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	DAL1	P32375	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	IOC3	P43596	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	MSN5	P52918	1224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	CWH41	P53008	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	KAR1	P11927	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
PAM18	YLR008C	ERP5	P38819	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	VAC8	P39968	578 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	JJJ2	P46997	583 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	COG4	Q06096	861 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	PUN1	Q06991	263 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	POL1	P13382	1468 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	TAF13	P11747	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	UBP1	P25037	809 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	SEC8	P32855	1065 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	VTC4	P47075	721 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
PAM18	YLR008C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	NSE3	Q05541	303 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAM18	YLR008C	MCM1	P11746	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	IRE1	P32361	1115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	OSH7	P38755	437 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	CAF120	P53836	1060 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	ALD3	P54114	506 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	MEH1	Q02205	184 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	ENT2	Q05785	613 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	STB3	Q12427	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	NKP1	Q12493	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	STU1	P38198	1513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	SEC6	P32844	805 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	GRX7	P38068	203 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	FUI1	P38196	639 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	YTA6	P40328	754 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	YJR142W	P47173	342 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.5 ms