RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W ALA1P40825 983 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W PIN2Q12057 282 aa6.56□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W Q0182Q9ZZW1 134 aa6.56□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W VRP1P37370 817 aa6.55□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W RAD55P38953 406 aa6.55□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W YGR122WP53272 402 aa6.55□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W RSC4Q02206 625 aa6.55□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W BSC2Q05611 235 aa6.55□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W DYS1P38791 387 aa6.54□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W CYC8P14922 966 aa6.53□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W PET112P33893 541 aa6.53□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W FIR1P40020 876 aa6.53□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W RTT106P40161 455 aa6.53□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W QDR2P40474 542 aa6.53□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W YNL165WP53891 406 aa6.53□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W HED1Q03937 162 aa6.53□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W MLF3P32047 452 aa6.52□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W CWC24P53769 259 aa6.52□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W TOS4Q06266 489 aa6.52□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W RAD2P07276 1031 aa6.51□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W MSN1P22148 382 aa6.51□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W MNR2P35724 969 aa6.51□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W NTA1P40354 457 aa6.51□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W HXK1P04806 485 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W IRS4P36115 615 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W FAA3P39002 694 aa6.5□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W YTA6P40328 754 aa6.5□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W RGD2P43556 714 aa6.5□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W YAF9P53930 226 aa6.5□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W DOS2P54858 310 aa6.5□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W DAL4Q04895 635 aa6.5□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W INP54Q08227 384 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W SPC42P36094 363 aa6.49□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W PSY2P40164 858 aa6.49□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W YBR287WP38355 427 aa6.48□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W YHL008CP38750 627 aa6.48□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W SSN3P39073 555 aa6.48□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W RNH70P53331 553 aa6.48□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W MET32Q12041 191 aa6.48□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W UGA3P26370 528 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W KAP122P32767 1081 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W MRPS18P42847 217 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W IOC3P43596 787 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W JJJ2P46997 583 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W YJL049WP47048 450 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W YCS4Q06156 1176 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR047WYKR047W ISW1P38144 1129 aa6.46□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W MCD1Q12158 566 aa6.46□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W FLP1P03870 423 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W RPS31P05759 152 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W ARG82P07250 355 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W AMS1P22855 1083 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W PPG1P32838 368 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W PRP40P33203 583 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W GIP1P38229 639 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W BSD2P38356 321 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W RGA1P39083 1007 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W CLA4P48562 842 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W MSN5P52918 1224 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W MTO1P53070 669 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W NSE3Q05541 303 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W KAR2P16474 682 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W PRE9P23638 258 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W AHP1P38013 176 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W AAD14P42884 376 aa6.44□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W OSW7P43611 510 aa6.44□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W YOR296WQ08748 1289 aa6.44□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W IRE1P32361 1115 aa6.43□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W ECM2P38241 364 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W CIT2P08679 460 aa6.42□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data6.42□□□□□ -1.38not detected
YKR047WYKR047W RPC31P17890 251 aa6.42□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W MCM5P29496 775 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W AIM46P38885 310 aa6.42□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W HST3P53687 447 aa6.42□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W GDE1Q02979 1223 aa6.42□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data6.41□□□□□ -1.38not detected
YKR047WYKR047W FAA4P47912 694 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W MON1P53129 644 aa6.41□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W YPL109CQ02981 657 aa6.41□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W YOR131CQ12486 218 aa6.41□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W CDC4P07834 779 aa6.4□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W CDC34P14682 295 aa6.4□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W UGA4P32837 571 aa6.4□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W BCK2P33306 851 aa6.4□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W ULP1Q02724 621 aa6.4□□□□□ -1.38
YKR047WYKR047W PRI2P20457 528 aa6.39□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W PDC6P26263 563 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 151.3 ms