RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	BDP1	P46678	594 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	YGR122W	P53272	402 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	STE6	P12866	1290 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	CYC8	P14922	966 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	SCD5	P34758	872 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	LDH1	P38139	375 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	YHL008C	P38750	627 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	FIR1	P40020	876 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	IOC3	P43596	787 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	BSC2	Q05611	235 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	YOR131C	Q12486	218 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	RAD2	P07276	1031 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	CIT2	P08679	460 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	KTR2	P33550	425 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	MNR2	P35724	969 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	RAD55	P38953	406 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	MRPS18	P42847	217 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	SUM1	P46676	1062 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	MTO1	P53070	669 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	FAR11	P53917	953 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	DAL4	Q04895	635 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	NSE3	Q05541	303 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	MCM1	P11746	286 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.64	□□□□□ -1.83	not detected
YMR31	YFR049W	FAA3	P39002	694 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	YJL049W	P47048	450 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	TOS4	Q06266	489 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	YPQ2	Q06328	317 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	BMT6	Q12291	365 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	PRI2	P20457	528 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	YBL086C	P38177	466 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	DYS1	P38791	387 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	QDR2	P40474	542 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	YJL171C	P46992	396 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	ALG12	P53730	551 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.63	□□□□□ -1.83	not detected
YMR31	YFR049W	RSC4	Q02206	625 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	GDE1	Q02979	1223 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	MLF3	P32047	452 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	YTA6	P40328	754 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	YNL165W	P53891	406 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	YCS4	Q06156	1176 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	MSN1	P22148	382 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.61	□□□□□ -1.83	not detected
YMR31	YFR049W	YBR287W	P38355	427 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	PSY2	P40164	858 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	NTA1	P40354	457 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	RGD2	P43556	714 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	RPN4	Q03465	531 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	MCD1	Q12158	566 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	TSR4	P25040	408 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	RGA1	P39083	1007 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	TIM54	P47045	478 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	HUL5	P53119	910 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	MON1	P53129	644 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	BDF2	Q07442	638 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	FLP1	P03870	423 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	RAD4	P14736	754 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	SDH2	P21801	266 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	KAP122	P32767	1081 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	UGA4	P32837	571 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	ISW1	P38144	1129 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YMR31	YFR049W	CDC34	P14682	295 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	UGA3	P26370	528 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	VRP1	P37370	817 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	GIP1	P38229	639 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	BSD2	P38356	321 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	AIM46	P38885	310 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	MNN1	P39106	762 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	BUD6	P41697	788 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	YJR008W	P47085	338 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	ULP1	Q02724	621 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	OPI10	Q08202	246 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	GCR1	P07261	785 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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