RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTT105	YER104W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RTT105	YER104W	YBL036C	P38197	257 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RTT105	YER104W	SAF1	P38352	637 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RTT105	YER104W	RNQ1	P25367	405 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	MCM1	P11746	286 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	YCR015C	P25616	317 aa		5	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	MLF3	P32047	452 aa		5	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	YKL222C	P35995	705 aa		5	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	YPP1	P46951	817 aa		5	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	CYC7	P00045	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	PKC1	P24583	1151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	SKP1	P52286	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	SLP1	Q12232	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTT105	YER104W	SPO74	P45819	413 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	MTO1	P53070	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	NTH2	P35172	780 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	AKR1	P39010	764 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
RTT105	YER104W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	NIT1	P40447	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	BIO2	P32451	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	SEG2	P34250	1132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	YJL007C	P47080	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	YNR040W	P53736	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	YNL108C	P53929	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTT105	YER104W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	APM2	P38700	605 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	MRP10	O75012	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	ESC8	Q08119	714 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	KAP122	P32767	1081 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	LRG1	P35688	1017 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	RIM21	P48565	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	DSE4	P53753	1117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	REC8	Q12188	680 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	TED1	P40533	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	ECL1	P48235	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	CYT1	P07143	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	BIM1	P40013	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	IDI1	P15496	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	SEA4	P38164	1038 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	GIP2	P40036	548 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	TSC13	Q99190	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTT105	YER104W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	RPC31	P17890	251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	GIP4	P39732	760 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	ATG32	P40458	529 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	SDH1	Q00711	640 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	TAF1	P46677	1066 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	DFG16	Q99234	619 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	SCD5	P34758	872 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	MRX10	Q05648	414 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	HXT5	P38695	592 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	ITC1	P53125	1264 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTT105	YER104W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	QDR2	P40474	542 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	YML020W	Q03722	664 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	UBP1	P25037	809 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	SIS2	P36024	562 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	GEF1	P37020	779 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	PEP12	P32854	288 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	YHL008C	P38750	627 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	HDA2	Q06629	674 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	AIM44	Q99299	758 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RTT105	YER104W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	KTR7	P40504	517 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	RSC2	Q06488	889 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	CDA2	Q06703	312 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	HAP4	P14064	554 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	NCE103	P53615	221 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	PHO87	P25360	923 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	CPS1	P27614	576 aa		4.69	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.5 ms