RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W PAU17Q12370 124 aa-0.4□□□□□ -2.47
NTF2YER009W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
NTF2YER009W SWR1Q05471 1514 aa-0.4□□□□□ -2.47
NTF2YER009W YAL065CO13511 128 aa-0.41□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YBR032WP38223 100 aa-0.41□□□□□ -2.48
NTF2YER009W SNU13P39990 126 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
NTF2YER009W TOS6P48560 102 aa-0.41□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YDR029WQ12111 104 aa-0.41□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YGL258W-AQ3E740 77 aa-0.41□□□□□ -2.48
NTF2YER009W MHF2Q3E829 80 aa-0.41□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YOR072W-BQ3E832 53 aa-0.41□□□□□ -2.48
NTF2YER009W VPS15P22219 1454 aa-0.41□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YDR042CQ03205 200 aa-0.42□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa-0.42□□□□□ -2.48
NTF2YER009W POL1P13382 1468 aa-0.42□□□□□ -2.48
NTF2YER009W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
NTF2YER009W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
NTF2YER009W COA2Q3E823 68 aa-0.43□□□□□ -2.48
NTF2YER009W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
NTF2YER009W HAP1P0CE41 1502 aa-0.43□□□□□ -2.48
NTF2YER009W GDB1Q06625 1536 aa-0.43□□□□□ -2.48
NTF2YER009W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YIL156W-BQ2V2P4 73 aa-0.44□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa-0.44□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa-0.44□□□□□ -2.48
NTF2YER009W RRT15Q3E811 62 aa-0.44□□□□□ -2.48
NTF2YER009W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
NTF2YER009W ATP17Q06405 101 aa-0.45□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YOR343CQ12484 108 aa-0.45□□□□□ -2.48
NTF2YER009W REV3P14284 1504 aa-0.45□□□□□ -2.48
NTF2YER009W TY1B-DR4Q07793 1604 aa-0.46□□□□□ -2.48
NTF2YER009W LSM2P38203 95 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
NTF2YER009W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YOR105WQ08504 108 aa-0.46□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa-0.46□□□□□ -2.48
NTF2YER009W SUS1Q6WNK7 96 aa-0.46□□□□□ -2.48
NTF2YER009W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YBL039W-BP0C268 59 aa-0.47□□□□□ -2.48
NTF2YER009W SCP1Q08873 200 aa-0.47□□□□□ -2.48
NTF2YER009W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YOR314WQ12506 109 aa-0.47□□□□□ -2.48
NTF2YER009W YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa-0.47□□□□□ -2.48
NTF2YER009W NUM1Q00402 2748 aa-0.47□□□□□ -2.49
NTF2YER009W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
NTF2YER009W CSF1Q12150 2958 aa-0.48□□□□□ -2.49
NTF2YER009W GCN2P15442 1659 aa-0.48□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YDL022C-AP0C5L6 82 aa-0.48□□□□□ -2.49
NTF2YER009W RPS27BP38711 82 aa-0.48□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YOR192C-CQ3E736 78 aa-0.48□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YBR200W-AQ3E755 54 aa-0.48□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa-0.48□□□□□ -2.49
NTF2YER009W MDS3P53094 1487 aa-0.48□□□□□ -2.49
NTF2YER009W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
NTF2YER009W DNF1P32660 1571 aa-0.49□□□□□ -2.49
NTF2YER009W THO2P53552 1597 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
NTF2YER009W DNF2Q12675 1612 aa-0.49□□□□□ -2.49
NTF2YER009W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YKL068W-AQ3E826 78 aa-0.49□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YGR146C-AQ8TGT9 53 aa-0.49□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YCL001W-BQ96VH2 84 aa-0.49□□□□□ -2.49
NTF2YER009W Q0017Q9ZZX8 53 aa-0.49□□□□□ -2.49
NTF2YER009W MMS22Q06164 1454 aa-0.49□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YOR093CQ12275 1648 aa-0.49□□□□□ -2.49
NTF2YER009W SSS1P35179 80 aa-0.5□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa-0.5□□□□□ -2.49
NTF2YER009W HUB1Q6Q546 73 aa-0.5□□□□□ -2.49
NTF2YER009W PDR12Q02785 1511 aa-0.5□□□□□ -2.49
NTF2YER009W VMR1P38735 1592 aa-0.5□□□□□ -2.49
NTF2YER009W CUP1-1P0CX80 61 aa-0.51□□□□□ -2.49
NTF2YER009W CUP1-2P0CX81 61 aa-0.51□□□□□ -2.49
NTF2YER009W IRA1P18963 3092 aa-0.51□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YBT1P32386 1661 aa-0.51□□□□□ -2.49
NTF2YER009W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
NTF2YER009W IML1P47170 1584 aa-0.51□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YMR082CQ04276 118 aa-0.51□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YSP2Q06681 1438 aa-0.51□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YOR011W-AQ3E807 68 aa-0.51□□□□□ -2.49
NTF2YER009W DOP1Q03921 1698 aa-0.52□□□□□ -2.49
NTF2YER009W ESP1Q03018 1630 aa-0.52□□□□□ -2.49
NTF2YER009W QCR9P22289 66 aa-0.52□□□□□ -2.49
NTF2YER009W PAU7P39545 55 aa-0.52□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa-0.52□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YLR157W-DP0CE99 70 aa-0.53□□□□□ -2.49
NTF2YER009W TIM12P32830 109 aa-0.53□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa-0.53□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YML054C-AQ3E809 52 aa-0.53□□□□□ -2.49
NTF2YER009W YGR121W-AQ3E816 71 aa-0.53□□□□□ -2.49
NTF2YER009W FLO1P32768 1537 aa-0.54□□□□□ -2.5
NTF2YER009W RPO31P04051 1460 aa-0.54□□□□□ -2.5
NTF2YER009W IQG1Q12280 1495 aa-0.54□□□□□ -2.5
NTF2YER009W TRA1P38811 3744 aa-0.54□□□□□ -2.5
NTF2YER009W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
NTF2YER009W YBR230W-AQ3E762 66 aa-0.54□□□□□ -2.5
NTF2YER009W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa-0.54□□□□□ -2.5
NTF2YER009W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
NTF2YER009W LTE1P07866 1435 aa-0.55□□□□□ -2.5
NTF2YER009W ULS1Q08562 1619 aa-0.55□□□□□ -2.5
NTF2YER009W YDR034C-AP0C289 58 aa-0.55□□□□□ -2.5
NTF2YER009W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
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