RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	RPL43B	P0CX26	92 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	BPH1	P25356	2167 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	YBR013C	P38215	129 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	RGM1	Q00453	211 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	YHR213W	P0CI67	198 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	YBR027C	P38220	110 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	YCR085W	P25650	117 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	YHL005C	P38752	130 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	PAU5	P43575	122 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		2.65	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	HMRA2	P0CY13	119 aa		2.65	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	SSS1	P35179	80 aa		2.65	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	RSM18	P40033	138 aa		2.65	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	YFL065C	P43539	102 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	YPR203W	Q08994	102 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	POR2	P40478	281 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	ENV10	Q99382	181 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	FLO9	P39712	1322 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	ICY1	Q04329	127 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	PFY1	P07274	126 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	LST8	P41318	303 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	YPR096C	O13587	100 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	YEL008W	P40001	126 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	SED1	Q01589	338 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	ROX3	P25046	220 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	IMP2	P46972	177 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	MIX17	Q03667	156 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	YMR122C	Q03879	124 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	ICS3	P47034	131 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	PRM3	Q08931	133 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SYF1	YDR416W	YIL163C	P40448	117 aa		2.58	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	VAM10	Q08474	114 aa		2.58	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		2.58	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YLR162W	Q06235	118 aa		2.57	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	MHF2	Q3E829	80 aa		2.57	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	STT4	P37297	1900 aa		2.57	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	PAI3	P01094	68 aa		2.57	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	TOM6	P33448	61 aa		2.57	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YBR219C	P38317	127 aa		2.56	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YOL118C	Q08259	102 aa		2.56	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YOL131W	Q08270	108 aa		2.56	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	COA3	Q3E7B2	85 aa		2.56	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	PRM7	Q12459	698 aa		2.56	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	HFA1	P32874	2273 aa		2.55	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YDL012C	Q12489	107 aa		2.55	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		2.55	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	MEC1	P38111	2368 aa		2.55	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	SNA2	P56508	79 aa		2.55	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		2.55	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	SPC1	P46965	94 aa		2.54	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YCL042W	P25572	119 aa		2.54	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YBR032W	P38223	100 aa		2.53	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YHL037C	P38733	133 aa		2.53	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	VPS55	P47111	140 aa		2.53	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		2.53	□□□□□ -2
SYF1	YDR416W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		2.53	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	MRP17	P28778	131 aa		2.52	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		2.52	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	IRA1	P18963	3092 aa		2.52	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	CCW12	Q12127	133 aa		2.52	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		2.52	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	PAU6	P0CE90	120 aa		2.5	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	PAU18	P0CE91	120 aa		2.5	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	MIC27	P50945	234 aa		2.5	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		2.5	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		2.5	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	YBL071C	P38185	102 aa		2.49	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	IRC21	Q04772	201 aa		2.49	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	YNL198C	P40166	100 aa		2.49	□□□□□ -2.01
SYF1	YDR416W	YOR343C	Q12484	108 aa		2.48	□□□□□ -2.01

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