Protein–RNA interactions for Protein: Q12127

CCW12, Covalently-linked cell wall protein 12, yeastyeast

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCW12Q12127 NSR1YGR159C 1245 nt15.51■□□□□ 0.07
CCW12Q12127 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.45■□□□□ 0.06
CCW12Q12127 NOP1YDL014W 984 nt14.97□□□□□ -0.01
CCW12Q12127 MDJ1YFL016C 1536 nt13.95□□□□□ -0.18
CCW12Q12127 YKL036CYKL036C 393 nt13.59□□□□□ -0.23
CCW12Q12127 SRX1YKL086W 384 nt13.03□□□□□ -0.32
CCW12Q12127 Q0297Q0297 156 nt12.98□□□□□ -0.33
CCW12Q12127 YJL027CYJL027C 417 nt12.9□□□□□ -0.34
CCW12Q12127 YCR051WYCR051W 669 nt12.38□□□□□ -0.43
CCW12Q12127 SCS3YGL126W 1143 nt12.23□□□□□ -0.45
CCW12Q12127 DBP2YNL112W 1641 nt12.2□□□□□ -0.46
CCW12Q12127 YBR190WYBR190W 312 nt11.96□□□□□ -0.49
CCW12Q12127 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.88□□□□□ -0.51
CCW12Q12127 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.88□□□□□ -0.51
CCW12Q12127 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.88□□□□□ -0.51
CCW12Q12127 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.88□□□□□ -0.51
CCW12Q12127 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.88□□□□□ -0.51
CCW12Q12127 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.88□□□□□ -0.51
CCW12Q12127 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.88□□□□□ -0.51
CCW12Q12127 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.88□□□□□ -0.51
CCW12Q12127 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.88□□□□□ -0.51
CCW12Q12127 CCC1YLR220W 969 nt11.81□□□□□ -0.52
CCW12Q12127 YOL085CYOL085C 342 nt11.75□□□□□ -0.53
CCW12Q12127 RTC3YHR087W 336 nt11.73□□□□□ -0.53
CCW12Q12127 RPP1BYDL130W 321 nt11.66□□□□□ -0.54
CCW12Q12127 PKP1YIL042C 1185 nt11.61□□□□□ -0.55
CCW12Q12127 RVS167YDR388W 1449 nt11.56□□□□□ -0.56
CCW12Q12127 SCJ1YMR214W 1134 nt11.34□□□□□ -0.59
CCW12Q12127 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.19□□□□□ -0.62
CCW12Q12127 PET122YER153C 765 nt11.14□□□□□ -0.63
CCW12Q12127 SHR5YOL110W 714 nt11.05□□□□□ -0.64
CCW12Q12127 SCR1SCR1 522 nt11.04□□□□□ -0.64
CCW12Q12127 PUT4YOR348C 1884 nt10.96□□□□□ -0.65
CCW12Q12127 ATS1YAL020C 1002 nt10.89□□□□□ -0.67
CCW12Q12127 URN1YPR152C 1398 nt10.87□□□□□ -0.67
CCW12Q12127 RRN5YLR141W 1092 nt10.82□□□□□ -0.68
CCW12Q12127 YDJ1YNL064C 1230 nt10.82□□□□□ -0.68
CCW12Q12127 DEP1YAL013W 1218 nt10.81□□□□□ -0.68
CCW12Q12127 OPI9YLR338W 858 nt10.73□□□□□ -0.69
CCW12Q12127 SAH1YER043C 1350 nt10.71□□□□□ -0.69
CCW12Q12127 RPN10YHR200W 807 nt10.71□□□□□ -0.69
CCW12Q12127 ARE1YCR048W 1833 nt10.7□□□□□ -0.7
CCW12Q12127 SSA3YBL075C 1950 nt10.66□□□□□ -0.7
CCW12Q12127 GAR1YHR089C 618 nt10.64□□□□□ -0.71
CCW12Q12127 YNL208WYNL208W 600 nt10.64□□□□□ -0.71
CCW12Q12127 POA1YBR022W 534 nt10.64□□□□□ -0.71
CCW12Q12127 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.61□□□□□ -0.71
CCW12Q12127 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.59□□□□□ -0.71
CCW12Q12127 RSB1YOR049C 1065 nt10.57□□□□□ -0.72
CCW12Q12127 PUN1YLR414C 792 nt10.46□□□□□ -0.73
CCW12Q12127 BSC6YOL137W 1494 nt10.44□□□□□ -0.74
CCW12Q12127 BUD23YCR047C 828 nt10.39□□□□□ -0.75
CCW12Q12127 YJR018WYJR018W 363 nt10.36□□□□□ -0.75
CCW12Q12127 PTC2YER089C 1395 nt10.35□□□□□ -0.75
CCW12Q12127 TIR1YER011W 765 nt10.28□□□□□ -0.76
CCW12Q12127 NAB2YGL122C 1578 nt10.24□□□□□ -0.77
CCW12Q12127 SSA1YAL005C 1929 nt10.16□□□□□ -0.78
CCW12Q12127 RPP2BYDR382W 333 nt10.15□□□□□ -0.78
CCW12Q12127 PST2YDR032C 597 nt10.09□□□□□ -0.79
CCW12Q12127 FPR4YLR449W 1179 nt10.09□□□□□ -0.79
CCW12Q12127 DAL1YIR027C 1383 nt10.07□□□□□ -0.8
CCW12Q12127 YJR120WYJR120W 351 nt10.07□□□□□ -0.8
CCW12Q12127 INM2YDR287W 879 nt10.03□□□□□ -0.8
CCW12Q12127 FIS1YIL065C 468 nt10.03□□□□□ -0.8
CCW12Q12127 SPT5YML010W 3192 nt9.97□□□□□ -0.81
CCW12Q12127 PHO4YFR034C 939 nt9.96□□□□□ -0.82
CCW12Q12127 SRB2YHR041C 633 nt9.89□□□□□ -0.83
CCW12Q12127 YBL100CYBL100C 315 nt9.89□□□□□ -0.83
CCW12Q12127 BDH2YAL061W 1254 nt9.85□□□□□ -0.83
CCW12Q12127 YPS1YLR120C 1710 nt9.82□□□□□ -0.84
CCW12Q12127 MEP2YNL142W 1500 nt9.82□□□□□ -0.84
CCW12Q12127 WWM1YFL010C 636 nt9.78□□□□□ -0.84
CCW12Q12127 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.78□□□□□ -0.84
CCW12Q12127 SSA4YER103W 1929 nt9.78□□□□□ -0.84
CCW12Q12127 FUN26YAL022C 1554 nt9.75□□□□□ -0.85
CCW12Q12127 TRM9YML014W 840 nt9.74□□□□□ -0.85
CCW12Q12127 YDR095CYDR095C 411 nt9.73□□□□□ -0.85
CCW12Q12127 SHU1YHL006C 453 nt9.73□□□□□ -0.85
CCW12Q12127 ALF1YNL148C 765 nt9.72□□□□□ -0.85
CCW12Q12127 YGR021WYGR021W 873 nt9.7□□□□□ -0.86
CCW12Q12127 LSM3YLR438C-A 270 nt9.69□□□□□ -0.86
CCW12Q12127 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.66□□□□□ -0.86
CCW12Q12127 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.65□□□□□ -0.86
CCW12Q12127 YKL097CYKL097C 411 nt9.64□□□□□ -0.87
CCW12Q12127 DCW1YKL046C 1350 nt9.63□□□□□ -0.87
CCW12Q12127 HOM6YJR139C 1080 nt9.61□□□□□ -0.87
CCW12Q12127 CCT6YDR188W 1641 nt9.6□□□□□ -0.87
CCW12Q12127 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.59□□□□□ -0.87
CCW12Q12127 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.59□□□□□ -0.87
CCW12Q12127 RPP2AYOL039W 321 nt9.57□□□□□ -0.88
CCW12Q12127 YMR090WYMR090W 684 nt9.56□□□□□ -0.88
CCW12Q12127 EMI2YDR516C 1503 nt9.54□□□□□ -0.88
CCW12Q12127 MNP1YGL068W 585 nt9.53□□□□□ -0.88
CCW12Q12127 SIS1YNL007C 1059 nt9.5□□□□□ -0.89
CCW12Q12127 PTP1YDL230W 1008 nt9.48□□□□□ -0.89
CCW12Q12127 RKM5YLR137W 1104 nt9.47□□□□□ -0.89
CCW12Q12127 YDL221WYDL221W 552 nt9.45□□□□□ -0.9
CCW12Q12127 CAC2YML102W 1407 nt9.45□□□□□ -0.9
CCW12Q12127 YBR220CYBR220C 1683 nt9.39□□□□□ -0.91
CCW12Q12127 BDF1YLR399C 2061 nt9.37□□□□□ -0.91
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