RNA–Protein interactions for RNA: YKR086W

PRP16, Transcript of DEAH-box RNA helicase involved in second catalytic step of splicing and in exon ligation, yeast

Gene PRP16, Length 3,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP16	YKR086W	ELP6	Q04868	273 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PRP16	YKR086W	NKP2	Q06162	153 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PRP16	YKR086W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
PRP16	YKR086W	FPR2	P32472	135 aa		0.4	□□□□□ -2.34
PRP16	YKR086W	UGX2	P32772	223 aa		0.4	□□□□□ -2.34
PRP16	YKR086W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
PRP16	YKR086W	YPL067C	Q02754	198 aa		0.4	□□□□□ -2.34
PRP16	YKR086W	NHP10	Q03435	203 aa		0.4	□□□□□ -2.34
PRP16	YKR086W	NAT5	Q08689	176 aa		0.4	□□□□□ -2.34
PRP16	YKR086W	YOR015W	Q12169	119 aa		0.4	□□□□□ -2.34
PRP16	YKR086W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.4	□□□□□ -2.34
PRP16	YKR086W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.34
PRP16	YKR086W	VMA7	P39111	118 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	KNH1	P50112	268 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	UBC12	P52491	188 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	COX12	Q01519	83 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	GPI19	Q04082	140 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YMR320W	Q04897	101 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	CNL1	Q06333	122 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YER121W	P40076	114 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	POR2	P40478	281 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	DOC1	P53068	250 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	LCL1	Q02786	101 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YLR118C	Q12354	227 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	PAU21	P0CE86	164 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	PAU22	P0CE87	164 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YCR101C	P25607	182 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	CSH1	P38287	376 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	SNN1	P48232	102 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YNR077C	P53758	84 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	TMA23	Q03525	211 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	ANT1	Q06497	328 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	ATG10	Q07879	167 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	ATG41	Q12048	136 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	SPS2	P08459	502 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	SVP26	P38869	228 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YEL028W	P39989	153 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	DLS1	P40366	167 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	PAC10	P48363	199 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	MPC3	P53311	146 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	FRQ1	Q06389	190 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	UBC4	P15731	148 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	ATP15	P21306	62 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	CNB1	P25296	175 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	MGR2	Q02889	113 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	DAS2	Q12084	232 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	EMC6	Q12431	108 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	PSF1	Q12488	208 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	RTC6	O14464	93 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	PHS1	P40857	217 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	VPS55	P47111	140 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	PGA1	P53896	198 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	HOR7	Q05827	59 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	PHO13	P19881	312 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	SLM6	P38343	150 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	RPS27B	P38711	82 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YAR029W	P39549	74 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	VMA21	P41806	77 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	SIP18	P50263	79 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	SOM1	Q05676	74 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	RDI1	Q12434	202 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YBR292C	P38357	123 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YHR180W	P38868	163 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	RNH202	Q05635	350 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	IRC19	Q07843	230 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	LST8	P41318	303 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	BOL2	P53082	120 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	HSK3	P69852	69 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	NCE101	Q02820	53 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YOR343C	Q12484	108 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	SPI1	P40092	148 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	ODC2	Q99297	307 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	AQY2	P0CD90	149 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	FUN14	P18411	198 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	SGF11	Q03067	99 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YOL118C	Q08259	102 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	QCR10	P37299	77 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PRP16	YKR086W	RRT1	P38192	103 aa		0.36	□□□□□ -2.35

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