RNA–Protein interactions for RNA: YOR073W

SGO1, Transcript of Component of the spindle checkpoint, yeast

Gene SGO1, Length 1,773 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SGO1	YOR073W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	YHR130C	P38834	111 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	VMA7	P39111	118 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	YIL163C	P40448	117 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	HPA2	Q06592	156 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	RPL43B	P0CX26	92 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	RPB11	P38902	120 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	YAR029W	P39549	74 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	YFR035C	P43608	114 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	AIM11	P87275	137 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	TDA2	P40045	126 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	YLR042C	Q07990	161 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	COA6	Q3E846	104 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	ENV10	Q99382	181 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	LAA1	P39526	2014 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SGO1	YOR073W	DNA2	P38859	1522 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	APS2	Q00381	147 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	SWC7	Q06707	132 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	SRX1	P36077	127 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	COX23	P38824	151 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	PCC1	Q3E833	88 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	OST5	Q92316	86 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	MDS3	P53094	1487 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	PAU2	P32612	120 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	PAU24	P38155	120 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YER187W	P40102	141 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	CYB5	P40312	120 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	BUD4	P47136	1447 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	ECM5	Q03214	1411 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YCR099C	P25657	155 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	ATX1	P38636	73 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	POR2	P40478	281 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	PAM16	P42949	149 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	VPS55	P47111	140 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YMR321C	Q04898	105 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	SRB6	P32570	121 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YIR020C	P40575	100 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	VMA21	P41806	77 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	MRPS12	P53732	153 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	LCL1	Q02786	101 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	RUB1	Q03919	77 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YEA6	P39953	335 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	SNN1	P48232	102 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	DAD1	Q12248	94 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	RTR2	Q12378	196 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	SPP41	P38904	1435 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YOR304C-A	O14468	76 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	GTT1	P40582	234 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	ICS3	P47034	131 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YJR128W	P47162	119 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YGR164W	P53291	111 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	NHP10	Q03435	203 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	OCA6	Q12454	224 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YPK9	Q12697	1472 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	PAU19	P0CE85	124 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	PAU3	P25610	124 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	ARL3	Q02804	198 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	ZEO1	Q08245	113 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
SGO1	YOR073W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	MRP17	P28778	131 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	AUA1	P32450	94 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YRF1-6	P53819	1859 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	EMC5	P40540	141 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	COX12	Q01519	83 aa		0.4	□□□□□ -2.35

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