RNA–Protein interactions for RNA: YHL002W

HSE1, Transcript of Subunit of the endosomal Vps27p-Hse1p complex, yeast

Gene HSE1, Length 1,359 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HSE1	YHL002W	YOR304C-A	O14468	76 aa		1	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		1	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		1	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	YRF1-6	P53819	1859 aa		1	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.99	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	YBR013C	P38215	129 aa		0.99	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	SNF11	P38956	169 aa		0.99	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	YAR029W	P39549	74 aa		0.99	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	TDA2	P40045	126 aa		0.99	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	APS2	Q00381	147 aa		0.99	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	ARL3	Q02804	198 aa		0.99	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	GPI19	Q04082	140 aa		0.99	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	YLR042C	Q07990	161 aa		0.99	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	MDS3	P53094	1487 aa		0.99	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	RPB11	P38902	120 aa		0.98	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	YMR141C	P40211	102 aa		0.98	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	MIC27	P50945	234 aa		0.98	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		0.98	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
HSE1	YHL002W	YLR194C	Q05777	254 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	FIT3	Q08907	204 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	SPP41	P38904	1435 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	TY4B-J	P47024	1803 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	SRX1	P36077	127 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YIL163C	P40448	117 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	OCA6	Q12454	224 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	ENV10	Q99382	181 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YMR321C	Q04898	105 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	FYV7	Q12247	151 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	BNI1	P41832	1953 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	MYO1	P08964	1928 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	RPL43B	P0CX26	92 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YHR130C	P38834	111 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YFR035C	P43608	114 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	PAU12	P53343	120 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	RTR2	Q12378	196 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	TSC11	P40061	1430 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	PDR11	P40550	1411 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YCR099C	P25657	155 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	PAM16	P42949	149 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	OST5	Q92316	86 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	PAU2	P32612	120 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	DNA2	P38859	1522 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YEA6	P39953	335 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	CYB5	P40312	120 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	DAD1	Q12248	94 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	PCC1	Q3E833	88 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	SSN2	P38931	1420 aa		0.9	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	KRE5	P22023	1365 aa		0.9	□□□□□ -2.26
HSE1	YHL002W	PAU24	P38155	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	YER187W	P40102	141 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	POR2	P40478	281 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	ICS3	P47034	131 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	SNN1	P48232	102 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	MIC10	Q96VH5	97 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	YPK9	Q12697	1472 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	LAA1	P39526	2014 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	PDR10	P51533	1564 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	LYS2	P07702	1392 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	UBC5	P15732	148 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	COX23	P38824	151 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	GTT1	P40582	234 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	ZEO1	Q08245	113 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	SCP1	Q08873	200 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	RRT15	Q3E811	62 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	VPS55	P47111	140 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
HSE1	YHL002W	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.86	□□□□□ -2.27

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