RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W SLO1Q3E784 85 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR047WYKR047W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YKR047WYKR047W SRB8P25648 1427 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR047WYKR047W KIN28P06242 306 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR047WYKR047W YCR050CP25630 102 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR047WYKR047W MRPL15P36523 253 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR047WYKR047W SFT1P43682 97 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR047WYKR047W FIT1Q04433 528 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR047WYKR047W TVP18Q04767 167 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR047WYKR047W GPI11Q06636 219 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR047WYKR047W Q0144Q9ZZW2 109 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR047WYKR047W MYO4P32492 1471 aa2.33□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W DNA2P38859 1522 aa2.33□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W PEP1P32319 1579 aa2.33□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W KOG1P38873 1557 aa2.33□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W PHS1P40857 217 aa2.33□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W TSC11P40061 1430 aa2.33□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W SWR1Q05471 1514 aa2.32□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W RKR1Q04781 1562 aa2.32□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W ESP1Q03018 1630 aa2.32□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W MRP49P32388 137 aa2.32□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W RPS1AP33442 255 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W SDH7Q04401 133 aa2.32□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W SMC4Q12267 1418 aa2.32□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W YPK9Q12697 1472 aa2.32□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W QCR10P37299 77 aa2.31□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W YAL064WP39711 94 aa2.31□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W VAM10Q08474 114 aa2.31□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W YPR203WQ08994 102 aa2.31□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W HYP2P23301 157 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W MLP2P40457 1679 aa2.3□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W TY3B-GQ99315 1547 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W NUP159P40477 1460 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W MMS1Q06211 1407 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W MRPL44P19956 98 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W YBR027CP38220 110 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W NAT5Q08689 176 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W ULS1Q08562 1619 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W DNF1P32660 1571 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W YHL037CP38733 133 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W VMA7P39111 118 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W YFL051CP43552 160 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR047WYKR047W ATG2P53855 1592 aa2.27□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W VPS15P22219 1454 aa2.27□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W SFT2P38166 215 aa2.27□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W GAT4P40569 121 aa2.27□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W FRQ1Q06389 190 aa2.27□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W BEM2P39960 2167 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W VAR1P02381 398 aa2.26□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W MPC1P53157 130 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W BRP1P53194 125 aa2.26□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W WIP1Q2V2P8 89 aa2.26□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W IRC20Q06554 1556 aa2.25□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W FUN14P18411 198 aa2.25□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W DCV1P43595 202 aa2.25□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W SED1Q01589 338 aa2.25□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W MHF1Q3E835 90 aa2.25□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W RPO31P04051 1460 aa2.25□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W GCN2P15442 1659 aa2.25□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W YPL067CQ02754 198 aa2.24□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W YLR118CQ12354 227 aa2.24□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W YLR099W-AQ3E798 87 aa2.24□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W MDS3P53094 1487 aa2.23□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data2.23□□□□□ -2.05not detected
YKR047WYKR047W AIM11P87275 137 aa2.23□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W SAE3P89114 91 aa2.23□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W IQG1Q12280 1495 aa2.22□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W NMT1P14743 455 aa2.22□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W YGL149WP53116 101 aa2.22□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W SPC24Q04477 213 aa2.22□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W VTH1P40438 1549 aa2.22□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W VTH2P40890 1549 aa2.22□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W GDB1Q06625 1536 aa2.22□□□□□ -2.05
YKR047WYKR047W RPL33AP05744 107 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W YBT1P32386 1661 aa2.21□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W YGL014C-AP0C5N1 53 aa2.2□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W PAU21P0CE86 164 aa2.2□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W PAU22P0CE87 164 aa2.2□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W ANB1P19211 157 aa2.19□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W SRL3P36167 246 aa2.19□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W HSP10P38910 106 aa2.19□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W APS2Q00381 147 aa2.19□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W DNF2Q12675 1612 aa2.19□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W TY1B-DR3Q99231 1755 aa2.18□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W CAT8P39113 1433 aa2.18□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W SNT2P53127 1403 aa2.18□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W PDR12Q02785 1511 aa2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 136.4 ms