RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W USB1Q12208 290 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W TAO3P40468 2376 aa3.74□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W IMP1P28627 190 aa3.74□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W SRP21P32342 167 aa3.74□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W MRPS5P33759 307 aa3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W MIG3P39943 394 aa3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W YIL086CP40503 102 aa3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W SDS23P53172 527 aa3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W SWS2P53937 143 aa3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W YHP1Q04116 353 aa3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W API2Q04413 109 aa3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W SLO1Q3E784 85 aa3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W ATG40Q99325 256 aa3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W FLO9P39712 1322 aa3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W QRI5P32344 111 aa3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W MIC27P50945 234 aa3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W LDB16P25587 256 aa3.72□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W SEC72P39742 193 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W OXA1P39952 402 aa3.72□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W YNL198CP40166 100 aa3.72□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W PAI3P01094 68 aa3.71□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W HMRA1P0CY11 126 aa3.71□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W ANB1P19211 157 aa3.71□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W SRX1P36077 127 aa3.71□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W YGL118CP53132 145 aa3.71□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.71□□□□□ -1.81not detected
PRD1YCL057W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W RAV2Q03956 351 aa3.71□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W WIP1Q2V2P8 89 aa3.71□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W YLR363W-AQ3E747 85 aa3.71□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W BOL1Q3E793 110 aa3.71□□□□□ -1.81
PRD1YCL057W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W PGU1P47180 361 aa3.71□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W POP3P53833 195 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W HRD1Q08109 551 aa3.71□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W HEM4P06174 275 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YHR214C-DP0CX93 97 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W ROX3P25046 220 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W MRP49P32388 137 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W BRP1P53194 125 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W CAB4P53332 305 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W TOM7P53507 60 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W MIX14Q04341 121 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W RAF1Q06891 181 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W STF1P01098 86 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W RAD23P32628 398 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W FZF1P32805 299 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YHL044WP38727 235 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W HSK3P69852 69 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W SDC1Q03323 175 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YDR114CQ04597 100 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa3.7□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W UBC13P52490 153 aa3.69□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W VPS71Q03433 280 aa3.69□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W DPP1Q05521 289 aa3.69□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YPS3Q12303 508 aa3.69□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W ADH1P00330 348 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W MRS1P07266 363 aa3.68□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YBR220CP38318 560 aa3.68□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YHR173CP38864 112 aa3.68□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YGR017WP53210 297 aa3.68□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YNR064CP53750 290 aa3.68□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W ATP19P81451 68 aa3.68□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W SPO24Q3E752 67 aa3.68□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W SFT2P38166 215 aa3.68□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W ECM33P38248 429 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YCH1P42937 148 aa3.68□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YFR045WP43617 309 aa3.68□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W UPS1Q05776 175 aa3.68□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W VPS63O13549 108 aa3.67□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W HSP12P22943 109 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W HYP2P23301 157 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W TOM40P23644 387 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YAR068WP39564 161 aa3.67□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YGL258W-AQ3E740 77 aa3.67□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YOS1Q3E834 85 aa3.67□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YOR376WQ08900 122 aa3.67□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W FIT2Q08906 153 aa3.67□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W TIR1P10863 254 aa3.66□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YGP1P38616 354 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YNL184CP53876 108 aa3.66□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W DIA1P54005 336 aa3.66□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W RFM1Q12192 310 aa3.66□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa3.66□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YMR31P19955 123 aa3.65□□□□□ -1.82
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