RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOP4	YJL192C	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	MSI1	P13712	422 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	PAM17	P36147	197 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	ECM14	P38836	430 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YHR180W	P38868	163 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	ELO1	P39540	310 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	PCL7	P40186	285 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	SAS2	P40963	338 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	CUP9	P41817	306 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YIP3	P53633	176 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YNL184C	P53876	108 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	DPP1	Q05521	289 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	HNT3	Q08702	217 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YOR304C-A	O14468	76 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	CUP2	P15315	225 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	FCY2	P17064	533 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	ERG8	P24521	451 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	FPR2	P32472	135 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YHR173C	P38864	112 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YJL213W	P40896	331 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	BRR6	P53062	197 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YIP5	P53108	310 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	PCP1	P53259	346 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YDL218W	Q07629	317 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	FIT3	Q08907	204 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	MRS1	P07266	363 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YPL073C	P40323	161 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	SPG5	P42933	373 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YNR048W	P53740	393 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
SOP4	YJL192C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YLR460C	P54007	376 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YDR042C	Q03205	200 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YLR281C	Q05863	155 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YOR186W	Q08560	144 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YLR112W	Q12130	139 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YDL180W	Q12301	547 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	GEP5	Q12393	293 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	TOM1	Q03280	3268 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	VPS63	O13549	108 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	KRE1	P17260	313 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YCR023C	P25351	611 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YOX1	P34161	385 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YKR041W	P36134	250 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	SWD3	P38123	315 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	DOG2	P38773	246 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	OSW5	P40219	148 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YIL163C	P40448	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YFR054C	P43622	192 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	TDA4	P47153	279 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	DSK2	P48510	373 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	AQR1	P53943	586 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	SUR7	P54003	302 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	DGA1	Q08650	418 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	AYT1	Q12226	474 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YMR31	P19955	123 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YCR006C	P25350	157 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	CSH1	P38287	376 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	SNF11	P38956	169 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	PAU7	P39545	55 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	MST28	P39552	234 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	EGT2	P42835	1041 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YFL065C	P43539	102 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YPI1	P43587	155 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	OST2	P46964	130 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	LCL3	P53153	274 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	MRX11	Q03079	207 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YPR203W	Q08994	102 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	SCS22	Q6Q595	175 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	BLM10	P43583	2143 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SOP4	YJL192C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91

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