RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	RDI1	Q12434	202 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		0.37	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	YGL193C	P53097	103 aa		0.37	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	YPR202W	Q08993	238 aa		0.37	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	FES1	P38260	290 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	YMR141C	P40211	102 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	FIP1	P45976	327 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	RCF2	P53721	224 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	IRC19	Q07843	230 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	RIB3	Q99258	208 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	SRP21	P32342	167 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	SEN15	Q04675	128 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	RFU1	Q08003	200 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	YLR053C	Q12026	108 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RSM27	YGR215W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	RPL43B	P0CX26	92 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	SLM6	P38343	150 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	DLS1	P40366	167 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	CHD1	P32657	1468 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	DNA2	P38859	1522 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	VPS51	P36116	164 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	DIE2	P50076	525 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	GPI11	Q06636	219 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	APQ12	P40532	138 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	YDR476C	Q03362	224 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	MAK3	Q03503	176 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	YPR153W	Q06537	140 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	ECM5	Q03214	1411 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	YER181C	P40097	107 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	UBR1	P19812	1950 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	PHO13	P19881	312 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	PEX34	P25584	144 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	TOM1	Q03280	3268 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	QCR2	P07257	368 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	AME1	P38313	324 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	VPS13	Q07878	3144 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	SAC3	P46674	1301 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	COX5B	P00425	151 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	DER1	P38307	211 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	YHR140W	P38842	239 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	GPI2	P46961	280 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	YJL009W	P47078	108 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	NSL1	Q12143	216 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	YPR117W	Q06116	2489 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RSM27	YGR215W	NUM1	Q00402	2748 aa		0.28	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	SWR1	Q05471	1514 aa		0.28	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	TEL1	P38110	2787 aa		0.28	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	YAP3	P38749	330 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	EST3	Q03096	181 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	YMR122C	Q03879	124 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	YPD1	Q07688	167 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	RRT7	Q07829	113 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	MHF1	Q3E835	90 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	TOR1	P35169	2470 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	ATP19	P81451	68 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	YCL001W-A	P87012	153 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	LTE1	P07866	1435 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	MMS1	Q06211	1407 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	REV3	P14284	1504 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	KOG1	P38873	1557 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	LAA1	P39526	2014 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	PEP1	P32319	1579 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	MDS3	P53094	1487 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	BUD4	P47136	1447 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	IRC21	Q04772	201 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	TAO3	P40468	2376 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	RPO31	P04051	1460 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	YPK9	Q12697	1472 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	LST8	P41318	303 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	MVB12	P42939	101 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	UFD4	P33202	1483 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	FMP27	Q06179	2628 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37

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