Protein–RNA interactions for Protein: P47078

YJL009W, Uncharacterized protein YJL009W, yeastyeast

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL009WP47078 NSR1YGR159C 1245 nt10.87□□□□□ -0.67
YJL009WP47078 YML009W-BYML009W-B 477 nt10.8□□□□□ -0.68
YJL009WP47078 NOP1YDL014W 984 nt10.52□□□□□ -0.73
YJL009WP47078 MDJ1YFL016C 1536 nt9.68□□□□□ -0.86
YJL009WP47078 YKL036CYKL036C 393 nt9.58□□□□□ -0.88
YJL009WP47078 Q0297Q0297 156 nt9.16□□□□□ -0.94
YJL009WP47078 SRX1YKL086W 384 nt9.16□□□□□ -0.94
YJL009WP47078 YJL027CYJL027C 417 nt8.97□□□□□ -0.97
YJL009WP47078 YCR051WYCR051W 669 nt8.65□□□□□ -1.02
YJL009WP47078 SCS3YGL126W 1143 nt8.63□□□□□ -1.03
YJL009WP47078 DBP2YNL112W 1641 nt8.51□□□□□ -1.05
YJL009WP47078 TRN1tP(UGG)A 72 nt8.35□□□□□ -1.07
YJL009WP47078 SUF9tP(UGG)F 72 nt8.35□□□□□ -1.07
YJL009WP47078 SUF8tP(UGG)H 72 nt8.35□□□□□ -1.07
YJL009WP47078 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt8.35□□□□□ -1.07
YJL009WP47078 SUF7tP(UGG)M 72 nt8.35□□□□□ -1.07
YJL009WP47078 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt8.35□□□□□ -1.07
YJL009WP47078 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt8.35□□□□□ -1.07
YJL009WP47078 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt8.35□□□□□ -1.07
YJL009WP47078 SUF11tP(UGG)O2 72 nt8.35□□□□□ -1.07
YJL009WP47078 YBR190WYBR190W 312 nt8.34□□□□□ -1.07
YJL009WP47078 YOL085CYOL085C 342 nt8.27□□□□□ -1.09
YJL009WP47078 RPP1BYDL130W 321 nt8.2□□□□□ -1.1
YJL009WP47078 CCC1YLR220W 969 nt8.19□□□□□ -1.1
YJL009WP47078 RTC3YHR087W 336 nt8.11□□□□□ -1.11
YJL009WP47078 PKP1YIL042C 1185 nt8.11□□□□□ -1.11
YJL009WP47078 RVS167YDR388W 1449 nt8.06□□□□□ -1.12
YJL009WP47078 RDN37-1RDN37-1 5354 nt8□□□□□ -1.13
YJL009WP47078 RDN37-2RDN37-2 5354 nt8□□□□□ -1.13
YJL009WP47078 SCJ1YMR214W 1134 nt7.93□□□□□ -1.14
YJL009WP47078 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt7.85□□□□□ -1.15
YJL009WP47078 YJL225CYJL225C 5277 nt7.84□□□□□ -1.16
YJL009WP47078 PET122YER153C 765 nt7.82□□□□□ -1.16
YJL009WP47078 SCR1SCR1 522 nt7.76□□□□□ -1.17
YJL009WP47078 SHR5YOL110W 714 nt7.75□□□□□ -1.17
YJL009WP47078 SSA3YBL075C 1950 nt7.73□□□□□ -1.17
YJL009WP47078 ATS1YAL020C 1002 nt7.69□□□□□ -1.18
YJL009WP47078 YDJ1YNL064C 1230 nt7.64□□□□□ -1.19
YJL009WP47078 PUT4YOR348C 1884 nt7.6□□□□□ -1.19
YJL009WP47078 RRN5YLR141W 1092 nt7.58□□□□□ -1.2
YJL009WP47078 URN1YPR152C 1398 nt7.56□□□□□ -1.2
YJL009WP47078 RPN10YHR200W 807 nt7.5□□□□□ -1.21
YJL009WP47078 OPI9YLR338W 858 nt7.49□□□□□ -1.21
YJL009WP47078 DEP1YAL013W 1218 nt7.47□□□□□ -1.21
YJL009WP47078 YER088W-BYER088W-B 147 nt7.44□□□□□ -1.22
YJL009WP47078 YNL208WYNL208W 600 nt7.44□□□□□ -1.22
YJL009WP47078 ARE1YCR048W 1833 nt7.43□□□□□ -1.22
YJL009WP47078 SAH1YER043C 1350 nt7.42□□□□□ -1.22
YJL009WP47078 GAR1YHR089C 618 nt7.41□□□□□ -1.22
YJL009WP47078 RSB1YOR049C 1065 nt7.4□□□□□ -1.22
YJL009WP47078 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt7.35□□□□□ -1.23
YJL009WP47078 POA1YBR022W 534 nt7.34□□□□□ -1.23
YJL009WP47078 PUN1YLR414C 792 nt7.3□□□□□ -1.24
YJL009WP47078 BSC6YOL137W 1494 nt7.23□□□□□ -1.25
YJL009WP47078 YJR018WYJR018W 363 nt7.21□□□□□ -1.26
YJL009WP47078 TIR1YER011W 765 nt7.19□□□□□ -1.26
YJL009WP47078 PTC2YER089C 1395 nt7.17□□□□□ -1.26
YJL009WP47078 BUD23YCR047C 828 nt7.16□□□□□ -1.26
YJL009WP47078 PST2YDR032C 597 nt7.14□□□□□ -1.27
YJL009WP47078 NAB2YGL122C 1578 nt7.12□□□□□ -1.27
YJL009WP47078 SSA1YAL005C 1929 nt7.09□□□□□ -1.27
YJL009WP47078 RPP2BYDR382W 333 nt7.08□□□□□ -1.28
YJL009WP47078 YJR120WYJR120W 351 nt7.05□□□□□ -1.28
YJL009WP47078 DAL1YIR027C 1383 nt7.02□□□□□ -1.29
YJL009WP47078 FIS1YIL065C 468 nt7.01□□□□□ -1.29
YJL009WP47078 INM2YDR287W 879 nt7□□□□□ -1.29
YJL009WP47078 FPR4YLR449W 1179 nt6.95□□□□□ -1.3
YJL009WP47078 PHO4YFR034C 939 nt6.93□□□□□ -1.3
YJL009WP47078 SPT5YML010W 3192 nt6.92□□□□□ -1.3
YJL009WP47078 SRB2YHR041C 633 nt6.91□□□□□ -1.3
YJL009WP47078 BDH2YAL061W 1254 nt6.9□□□□□ -1.3
YJL009WP47078 YBL100CYBL100C 315 nt6.89□□□□□ -1.31
YJL009WP47078 SHU1YHL006C 453 nt6.85□□□□□ -1.31
YJL009WP47078 YGR021WYGR021W 873 nt6.84□□□□□ -1.31
YJL009WP47078 YKL097CYKL097C 411 nt6.83□□□□□ -1.32
YJL009WP47078 YPS1YLR120C 1710 nt6.83□□□□□ -1.32
YJL009WP47078 WWM1YFL010C 636 nt6.82□□□□□ -1.32
YJL009WP47078 Q0182Q0182 405 nt6.82□□□□□ -1.32
YJL009WP47078 LSM3YLR438C-A 270 nt6.81□□□□□ -1.32
YJL009WP47078 MEP2YNL142W 1500 nt6.81□□□□□ -1.32
YJL009WP47078 YDR095CYDR095C 411 nt6.8□□□□□ -1.32
YJL009WP47078 FUN26YAL022C 1554 nt6.8□□□□□ -1.32
YJL009WP47078 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt6.79□□□□□ -1.32
YJL009WP47078 TRM9YML014W 840 nt6.78□□□□□ -1.32
YJL009WP47078 HOM6YJR139C 1080 nt6.77□□□□□ -1.33
YJL009WP47078 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt6.76□□□□□ -1.33
YJL009WP47078 ALF1YNL148C 765 nt6.75□□□□□ -1.33
YJL009WP47078 SSA4YER103W 1929 nt6.74□□□□□ -1.33
YJL009WP47078 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt6.73□□□□□ -1.33
YJL009WP47078 CCT6YDR188W 1641 nt6.72□□□□□ -1.33
YJL009WP47078 SUF2tP(AGG)C 72 nt6.71□□□□□ -1.34
YJL009WP47078 SUF10tP(AGG)N 72 nt6.71□□□□□ -1.34
YJL009WP47078 FPS1YLL043W 2010 nt6.67□□□□□ -1.34
YJL009WP47078 MNP1YGL068W 585 nt6.67□□□□□ -1.34
YJL009WP47078 RKM5YLR137W 1104 nt6.67□□□□□ -1.34
YJL009WP47078 RPP2AYOL039W 321 nt6.67□□□□□ -1.34
YJL009WP47078 DCW1YKL046C 1350 nt6.65□□□□□ -1.35
YJL009WP47078 SIS1YNL007C 1059 nt6.63□□□□□ -1.35
YJL009WP47078 YMR090WYMR090W 684 nt6.62□□□□□ -1.35
YJL009WP47078 YOL037CYOL037C 354 nt6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16 ms