RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeastyeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1YOL077C YPR127WQ06494 345 aa0.83□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C HRD1Q08109 551 aa0.83□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C HFA1P32874 2273 aa0.83□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C RIF1P29539 1916 aa0.83□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C RAD6P06104 172 aa0.82□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C CLG1P35190 452 aa0.82□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C ETR1P38071 380 aa0.82□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C NSE4P43124 402 aa0.82□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C TTI2P47168 421 aa0.82□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C YKR005CQ02203 525 aa0.82□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C YHP1Q04116 353 aa0.82□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C GAL83Q04739 417 aa0.82□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C YLR053CQ12026 108 aa0.82□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C ATG41Q12048 136 aa0.82□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data0.81□□□□□ -2.28not detected
BRX1YOL077C YKR041WP36134 250 aa0.81□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C FES1P38260 290 aa0.81□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C MOB1P40484 314 aa0.81□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C SRP102P36057 244 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C CCS1P40202 249 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C DCV1P43595 202 aa0.8□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C NQM1P53228 333 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C YML079WQ03629 201 aa0.8□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C ELP6Q04868 273 aa0.8□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C YPD1Q07688 167 aa0.8□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C GRE1Q08969 168 aa0.8□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C MAK31P23059 88 aa0.79□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C AME1P38313 324 aa0.79□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C UIP4Q08926 304 aa0.79□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C CCW12Q12127 133 aa0.79□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C RDI1Q12434 202 aa0.79□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C PRE1P22141 198 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C BUB2P26448 306 aaPredicted RBP0.78□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C PTC1P35182 281 aa0.78□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C YGL101WP53144 215 aa0.78□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C LSM3P57743 89 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C LIP1Q03579 150 aa0.78□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C THI74Q04083 370 aa0.78□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C SYM1Q06563 197 aa0.78□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C YDL157CQ12082 118 aa0.78□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP0.78□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
BRX1YOL077C FYV4P38783 130 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YEL073CP39974 107 aa0.77□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C DLS1P40366 167 aa0.77□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C GEP7P53171 287 aa0.77□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C EFM5P53200 248 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C ATP19P81451 68 aa0.77□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YLR046CQ12253 270 aa0.77□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C PRP8P33334 2413 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C ATP5P09457 212 aa0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C PEX34P25584 144 aa0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C FIG1P38224 298 aa0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YER121WP40076 114 aa0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YNL200CP40165 246 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YGR269WP40326 108 aa0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YJR015WP47090 510 aa0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C PAC10P48363 199 aa0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YNR064CP53750 290 aa0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C HSK3P69852 69 aa0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C RIM9Q04734 239 aa0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C ATG10Q07879 167 aa0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C NSL1Q12143 216 aa0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YOR381W-AQ3E804 55 aa0.76□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C SPS2P08459 502 aa0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YGL041W-AP0C5N3 154 aa0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C RPL30P14120 105 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C ARC19P33204 171 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C ECM31P38122 312 aa0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C DER1P38307 211 aa0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YEL028WP39989 153 aa0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C APQ12P40532 138 aa0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C CIN5P40917 295 aa0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YGL193CP53097 103 aa0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C RRT7Q07829 113 aa0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YKR070WP36151 352 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C HTD2P38790 280 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C APS3P47064 194 aa0.74□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C SOL1P50278 321 aa0.74□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C PKR1Q03880 122 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C RAV2Q03956 351 aa0.74□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C VAM10Q08474 114 aa0.74□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C TAF2P23255 1407 aa0.73□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YPT31P38555 223 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C PET20Q99373 253 aa0.73□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YOR1P53049 1477 aa0.73□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C INO4P13902 151 aa0.72□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C HYP2P23301 157 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C CSH1P38287 376 aa0.72□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C SLM6P38343 150 aa0.72□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YAP3P38749 330 aa0.72□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C CCC1P47818 322 aa0.72□□□□□ -2.29
BRX1YOL077C YGL230CP53074 147 aa0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25 ms