RNA–Protein interactions for RNA: YML028W

TSA1, Transcript of Thioredoxin peroxidase, yeast

Gene TSA1, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TSA1	YML028W	RKI1	Q12189	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YKR045C	P36138	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YAR068W	P39564	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	PGD1	P40356	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YHP1	Q04116	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	TMA10	Q06177	86 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	POS5	Q06892	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	FCY1	Q12178	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	MRPL4	P36517	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	PHS1	P40857	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YJL213W	P40896	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	HHO1	P53551	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	MCH1	Q07376	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	TMA17	Q12513	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	LAC1	P28496	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	AVT5	P38176	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	CSH1	P38287	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	DOG2	P38773	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	DOG1	P38774	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	BDH1	P39714	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	TAX4	P47030	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	TIM21	P53220	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
TSA1	YML028W	YCR022C	P25620	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
TSA1	YML028W	RRT1	P38192	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	CDS1	P38221	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	TRS20	P38334	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	PET100	P38958	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	MOG1	P47123	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YGR018C	P53211	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	LST7	P53237	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	SDH7	Q04401	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	ERV2	Q12284	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	CDC7	P06243	507 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	POP5	P28005	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	HMX1	P32339	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YKL075C	P36083	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	MRPS9	P38120	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	VMA21	P41806	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	DSK2	P48510	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	BNS1	P50084	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	LOA1	Q06508	300 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YCL042W	P25572	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	RPB9	P27999	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	SFT2	P38166	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	CYB5	P40312	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	ATG27	P46989	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YNR071C	P53757	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	YPS1	P32329	569 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	MIA40	P36046	403 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	ICS2	P38284	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	HSP10	P38910	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	YER188W	P40103	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	GTT1	P40582	234 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	PAU15	P40585	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	DAN1	P47178	298 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	MGA1	P53050	456 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	HST4	P53688	370 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	LDS2	Q08218	356 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	SRL1	Q08673	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	COQ3	P27680	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	SDH4	P37298	181 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	GPI2	P46961	280 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TSA1	YML028W	DAD3	P69850	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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