RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	SLM1	P40485	686 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAU15	P40585	124 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PHS1	P40857	217 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	EGT2	P42835	1041 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	MGA1	P53050	456 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	CGR1	P53188	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAU4	P53427	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	HCH1	P53834	153 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	HSK3	P69852	69 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	SEN15	Q04675	128 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	UPS1	Q05776	175 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	ERV2	Q12284	196 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YLR118C	Q12354	227 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	RIP1	P08067	215 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAU1	P0CE88	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAU14	P0CE89	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAU6	P0CE90	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAU18	P0CE91	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAU8	P0CE92	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAU11	P0CE93	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	LSB5	P25369	354 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	COQ3	P27680	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YBL059W	P34224	193 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	SSS1	P35179	80 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	QDR3	P38227	689 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	TRS20	P38334	175 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAU13	P38725	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	MBB1	P39534	108 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	RMD6	P39975	231 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PRM5	P40476	318 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	HIT1	P46973	164 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	TTI2	P47168	421 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YGL185C	P53100	379 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YIP5	P53108	310 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YDC1	Q02896	317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAU10	Q03050	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	AVO2	Q04749	426 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAU20	Q08322	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAU9	Q3E770	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	CDC7	P06243	507 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	ROX3	P25046	220 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	LDB16	P25587	256 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	WSS1	P38838	269 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	COX15	P40086	486 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	DFG10	P40526	253 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	GON7	P46984	123 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YGR149W	P48236	432 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	SIP18	P50263	79 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YGR050C	P53231	118 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	CRH1	P53301	507 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	DYN2	Q02647	92 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	RFM1	Q12192	310 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	BOL1	Q3E793	110 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	HEM4	P06174	275 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YOX1	P34161	385 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	MRPL28	P36527	147 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YMR262W	P38430	313 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	UBC13	P52490	153 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	RSM10	Q03201	203 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	HRD1	Q08109	551 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	MRS3	P10566	314 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	QCR9	P22289	66 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAU5	P43575	122 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	LST7	P53237	242 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	DAD3	P69850	94 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YPL067C	Q02754	198 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	LPP1	Q04396	274 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	CSF1	Q12150	2958 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	RPL39	P04650	51 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	PAU19	P0CE85	124 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	SEC62	P21825	274 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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