RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W APQ12P40532 138 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W CUP9P41817 306 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W BNS1P50084 137 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W MDM34P53083 459 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YGR050CP53231 118 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W PGA1P53896 198 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YDR249CQ03787 373 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W SLD7Q08457 257 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W IZH2Q12442 317 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YCR099CP25657 155 aa3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W SKG1P36169 355 aa3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YBR285WP38354 144 aa3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W COS10P52924 374 aa3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W UFD1P53044 361 aa3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W SDT1P53078 280 aa3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W ARO8P53090 500 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W ARL3Q02804 198 aa3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W IRC25Q07951 179 aa3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W IES3Q12345 250 aa3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YOR020W-AQ3E824 90 aa3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W TDA8Q6B2U8 126 aa3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W RIB3Q99258 208 aa3.29□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W PHO13P19881 312 aa3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W RPS27BP38711 82 aa3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W PTH1P38876 190 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W GGC1P38988 300 aa3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W AIM2P39721 246 aa3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YIL152WP40455 235 aa3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W MIC19P43594 170 aa3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W GPI14P47088 403 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W XPT1P47165 209 aa3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W BOR1P53838 576 aa3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W LSM3P57743 89 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W INP1Q03694 420 aa3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YDR115WQ04598 105 aa3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W NEJ1Q06148 342 aa3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YPR011CQ12251 326 aa3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W STT4P37297 1900 aa3.28□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YLR462WO13556 202 aa3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W SPO13P23624 291 aa3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W STP22P25604 385 aa3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W TFC1P32367 649 aa3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W FMP23P38231 175 aa3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W TEM1P38987 245 aa3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W VMA7P39111 118 aa3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W HPM1P40481 377 aa3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YOR376WQ08900 122 aa3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YPL264CQ08980 353 aa3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W DAS2Q12084 232 aa3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W PST1Q12355 444 aa3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W TSC3Q3E790 80 aa3.27□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YOR304C-AO14468 76 aa3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W ADH3P07246 375 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W CKS1P20486 150 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W OM14P38325 134 aa3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YGP1P38616 354 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W RGI1P40043 161 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W RFC2P40348 353 aa3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W DLS1P40366 167 aa3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W OST2P46964 130 aa3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W ARP3P47117 449 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YGL088WP53151 121 aa3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W HHO1P53551 258 aa3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YDR366CP87287 132 aa3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W CWC27Q02770 301 aa3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W COF1Q03048 143 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W LPP1Q04396 274 aa3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W HRD1Q08109 551 aa3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YIR021W-AQ3E739 70 aa3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YAL063C-AQ3E791 96 aa3.26□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YHR139C-AO13536 103 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W SFK1P35735 353 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YJL028WP47062 111 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YGL118CP53132 145 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YGR039WP53225 103 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W APS2Q00381 147 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W GAS3Q03655 524 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YMR320WQ04897 101 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W PBA1Q05778 276 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W CNL1Q06333 122 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YPL162CQ12042 273 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W FYV7Q12247 151 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W YDL180WQ12301 547 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W PRR2Q12310 699 aa3.25□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W SEC16P48415 2195 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PIR3YKL163W PET9P18239 318 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.6 ms