RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-2

RDN25-2, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-2, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-2RDN25-2 MSL1P40567 111 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RDN25-2RDN25-2 YJR115WP47152 169 aa8.34□□□□□ -1.07
RDN25-2RDN25-2 ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 HYP2P23301 157 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YCR023CP25351 611 aa8.33□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 SEC16P48415 2195 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 FPR1P20081 114 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 GPX1P36014 167 aa8.33□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 TEM1P38987 245 aa8.33□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 SCW4P53334 386 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 RNH201P53942 307 aa8.33□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 NCE101Q02820 53 aa8.33□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 GIS1Q03833 894 aa8.33□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 ATO3Q12359 275 aa8.33□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 OCH1P31755 480 aa8.33□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PAU1P0CE88 120 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PAU14P0CE89 120 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PAU6P0CE90 120 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PAU18P0CE91 120 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PAU8P0CE92 120 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PAU11P0CE93 120 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PAU16P35994 123 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PAU13P38725 120 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 CIS3P47001 227 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PAU10Q03050 120 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PAU20Q08322 120 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PAU9Q3E770 120 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PAM17P36147 197 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YEA4P40004 342 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 HSV2P50079 448 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 MCT1Q12283 360 aa8.32□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 SEC4P07560 215 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 HAC1P41546 238 aa8.31□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YDR102CQ03864 110 aa8.31□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 ASM4Q05166 528 aa8.31□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 NUD1P32336 851 aa8.31□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 SHB17P36136 271 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 FRM2P37261 193 aa8.31□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 DOG2P38773 246 aa8.31□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 SHR5P41912 237 aa8.31□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 MCH2P36032 473 aa8.31□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YER085CP40058 173 aa8.31□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 TDA7P53882 636 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 DAL82P21705 255 aa8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 MTR2P34232 184 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 RPS27AP35997 82 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 RPS27BP38711 82 aa8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 CAB4P53332 305 aa8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PAU4P53427 120 aa8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 NCE103P53615 221 aa8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YLR363W-AQ3E747 85 aa8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 SLM6P38343 150 aa8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 APS2Q00381 147 aa8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 WSC3Q12215 556 aa8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 RPB11P38902 120 aa8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YGR039WP53225 103 aa8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 GTO3Q04806 366 aa8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 SWT1Q12104 458 aa8.3□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 WSC4P38739 605 aa8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 MPP6P53725 186 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YMR166CQ03829 368 aa8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 RLM1Q12224 676 aa8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 MDM35O60200 86 aa8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 RPL7AP05737 244 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 ARF1P11076 181 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 SEC11P15367 167 aa8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 HSP150P32478 413 aa8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 SWD2P36104 329 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 ECM33P38248 429 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 OXA1P39952 402 aa8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YDL242WQ07746 117 aa8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YPL162CQ12042 273 aa8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YOR343CQ12484 108 aa8.29□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YFL068WP0CX99 160 aa8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YLL066W-AP0CY00 160 aa8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YLL067W-AP0CY01 160 aa8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YKR070WP36151 352 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 ERG13P54839 491 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 MRPL1Q04599 285 aa8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 STP4Q07351 490 aa8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 FMP49A0A023PZB3 126 aa8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 MTM1P53320 366 aa8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 YIP3P53633 176 aa8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 PRM3Q08931 133 aa8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 FCY2P17064 533 aa8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 NUP53Q03790 475 aa8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 MIM1Q08176 113 aa8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 POC4Q12245 148 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RDN25-2RDN25-2 SEC72P39742 193 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RDN25-2RDN25-2 YGL230CP53074 147 aa8.27□□□□□ -1.09
RDN25-2RDN25-2 YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RDN25-2RDN25-2 MKK2P32491 506 aa8.27□□□□□ -1.09
RDN25-2RDN25-2 GPP1P41277 250 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RDN25-2RDN25-2 DIC1Q06143 298 aa8.27□□□□□ -1.09
RDN25-2RDN25-2 MCP1Q12106 302 aa8.27□□□□□ -1.09
RDN25-2RDN25-2 YBR292CP38357 123 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.9 ms