RNA–Protein interactions for RNA: YOR259C

RPT4, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT4, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT4	YOR259C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	AHT1	P29589	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	OCH1	P31755	480 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	HSP150	P32478	413 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	EMP70	P32802	667 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YND1	P40009	630 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	HIT1	P46973	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	LCL3	P53153	274 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YLR460C	P54007	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	APS2	Q00381	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RCE1	Q03530	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	TRS23	Q03784	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	PIN3	Q06449	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	REX3	Q12090	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	ERV2	Q12284	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
RPT4	YOR259C	CDC26	P14724	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YGL010W	P25338	174 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	ERV1	P27882	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YKL075C	P36083	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	DAD2	P36162	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	POP2	P39008	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YEL057C	P39983	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	SHR5	P41912	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	CTK2	P46962	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	CWC27	Q02770	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	SEI1	Q06058	285 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	NDE2	Q07500	545 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	CSI2	Q08054	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	FRE7	Q12333	620 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	SWM1	Q12379	170 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	HUT1	Q12520	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	BLM10	P43583	2143 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	PAC2	P39937	518 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	CUP9	P41817	306 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	LST7	P53237	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YGR126W	P53274	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	PDR17	P53844	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YPL067C	Q02754	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	NAT3	Q06504	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	NAT5	Q08689	176 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	AKR2	Q12013	749 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	COX5B	P00425	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	PDX1	P16451	410 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	TCA17	P32613	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	SPC29	P33419	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RPB7	P34087	171 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RPN14	P53196	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YNR048W	P53740	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	STP4	Q07351	490 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	TGS1	Q12052	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	HAP3	P13434	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	ELF1	P36053	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	QDR3	P38227	689 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	UBS1	P38290	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YER010C	P40011	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	PAM18	Q07914	168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	SPO7	P18410	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	QCR9	P22289	66 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	SCO1	P23833	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	PEX4	P29340	183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YMR262W	P38430	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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