RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W NUP100Q02629 959 aa3.41□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W BET5Q03630 159 aa3.41□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W YLR042CQ07990 161 aa3.41□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W YPS3Q12303 508 aa3.41□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W IZH2Q12442 317 aa3.41□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W SRB8P25648 1427 aa3.41□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W PDR11P40550 1411 aa3.41□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-JR1P47098 1755 aa3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-ER1Q03612 1755 aa3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-GR2Q12269 1755 aa3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-OLQ12273 1755 aa3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W AUS1Q08409 1394 aa3.4□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W ATR1P13090 542 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W GPX2P38143 162 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W TRS20P38334 175 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YHL049CP38722 271 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YHR140WP38842 239 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W IPT1P38954 527 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W GAA1P39012 614 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W OST1P41543 476 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W GON7P46984 123 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YIP4P53093 235 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YGR026WP53217 278 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W WSC2P53832 503 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W OSH6Q02201 448 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W GAS3Q03655 524 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W FEX2Q08991 375 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W TSC3Q3E790 80 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YBL112CQ3E7Y4 105 aa3.4□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W SIN3P22579 1536 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W MBF1O14467 151 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W BI2P03873 423 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W COX10P21592 462 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YNK1P36010 153 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W SDH4P37298 181 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W CSH1P38287 376 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W RPB11P38902 120 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W AVT2P39981 480 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W PEX17P40155 199 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W SIM1P40472 476 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W PRM5P40476 318 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W TES1P41903 349 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YGR164WP53291 111 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YPL067CQ02754 198 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YML018CQ03730 393 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W SCW10Q04951 389 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W SWC7Q06707 132 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W SLD7Q08457 257 aa3.39□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W CAT8P39113 1433 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W COX5BP00425 151 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W RAD6P06104 172 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W CKS1P20486 150 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W LDS1P31379 325 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W EMP24P32803 203 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W UTP30P36144 274 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YCR041WP37265 110 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YPT10P38146 199 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YBR013CP38215 129 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W CAT5P41735 233 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W SAY1P53324 424 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W PGA1P53896 198 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W RNH201P53942 307 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YNL010WP53981 241 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W TRS23Q03784 219 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W KEI1Q06346 221 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W LOA1Q06508 300 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W TY1B-GR3Q12316 1755 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W TY1B-ORQ92393 1755 aa3.38□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W MMS22Q06164 1454 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W IQG1Q12280 1495 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YFR010W-AP0C5N0 62 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W MRS3P10566 314 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W HAP3P13434 144 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W FMT1P32785 401 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YBR063CP38083 404 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W LAG1P38703 411 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W TIM17P39515 158 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W FIP1P45976 327 aa3.37□□□□□ -1.87
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