RNA–Protein interactions for RNA: YMR294W

JNM1, Transcript of Component of the yeast dynactin complex, yeast

Gene JNM1, Length 1,122 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
JNM1	YMR294W	FEX1	Q08913	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	BBP1	Q12365	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	PCL7	P40186	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	PRM5	P40476	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	GIM3	P53900	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	CAB5	Q03941	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	ARR2	Q06597	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	SOR2	Q07786	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	FCY1	Q12178	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	ATO3	Q12359	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	DGK1	Q12382	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	CCW14	O13547	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	MRS4	P23500	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	ERG2	P32352	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	PPQ1	P32945	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	IKI1	P38874	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	FLO5	P38894	1075 aa		4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	BMT5	P40493	336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	NIF3	P53081	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	MIX17	Q03667	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	GEP3	Q08622	556 aa		4.94	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	PUT1	P09368	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	ROX3	P25046	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	LSB5	P25369	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	MRP17	P28778	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	YGR210C	P42942	411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	YJL118W	P47022	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	CRH1	P53301	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	YFH1	Q07540	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	ARG80	P07249	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	QCR2	P07257	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	PMU1	P36069	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	MEH1	Q02205	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	AEP3	Q12089	606 aa		4.92	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	DYN1	P36022	4092 aa		4.92	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	SPS18	P32572	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
JNM1	YMR294W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	YJR056C	P47115	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	DUG3	P53871	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	VPS28	Q02767	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	STD1	Q02794	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	LPP1	Q04396	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	YPD1	Q07688	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	SCM3	Q12334	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	ATG5	Q12380	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JNM1	YMR294W	YMR31	P19955	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	SUA5	P32579	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	YKR045C	P36138	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	YER188W	P40103	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	YJR012C	P47087	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	MSA1	Q08471	629 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	TCA17	P32613	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	LAG1	P38703	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	RRF1	P38771	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	YIR035C	P40579	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	MCH1	Q07376	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	HRD1	Q08109	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	YCT1	Q12235	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	PRM4	Q12498	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	SEC22	P22214	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	YPC1	P38298	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	ERV15	P38312	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	RFC2	P40348	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	YJL213W	P40896	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	RRT7	Q07829	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	SRL1	Q08673	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	JID1	Q12350	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	VPS63	O13549	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JNM1	YMR294W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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