Protein–RNA interactions for Protein: Q12365

BBP1, Spindle pole component BBP1, yeastyeast

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BBP1Q12365 NSR1YGR159C 1245 nt17.14■□□□□ 0.33
BBP1Q12365 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.94■□□□□ 0.3
BBP1Q12365 NOP1YDL014W 984 nt16.49■□□□□ 0.23
BBP1Q12365 MDJ1YFL016C 1536 nt15.75■□□□□ 0.11
BBP1Q12365 YKL036CYKL036C 393 nt15.1■□□□□ 0.01
BBP1Q12365 SSA3YBL075C 1950 nt15.02□□□□□ -0.01
BBP1Q12365 YJL027CYJL027C 417 nt14.39□□□□□ -0.11
BBP1Q12365 Q0297Q0297 156 nt14.35□□□□□ -0.11
BBP1Q12365 SRX1YKL086W 384 nt14.35□□□□□ -0.11
BBP1Q12365 YBR190WYBR190W 312 nt13.69□□□□□ -0.22
BBP1Q12365 SCS3YGL126W 1143 nt13.66□□□□□ -0.22
BBP1Q12365 YCR051WYCR051W 669 nt13.62□□□□□ -0.23
BBP1Q12365 DBP2YNL112W 1641 nt13.56□□□□□ -0.24
BBP1Q12365 RTC3YHR087W 336 nt13.29□□□□□ -0.28
BBP1Q12365 PUT4YOR348C 1884 nt13.27□□□□□ -0.28
BBP1Q12365 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.05□□□□□ -0.32
BBP1Q12365 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.05□□□□□ -0.32
BBP1Q12365 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.05□□□□□ -0.32
BBP1Q12365 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.05□□□□□ -0.32
BBP1Q12365 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.05□□□□□ -0.32
BBP1Q12365 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.05□□□□□ -0.32
BBP1Q12365 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.05□□□□□ -0.32
BBP1Q12365 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.05□□□□□ -0.32
BBP1Q12365 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.05□□□□□ -0.32
BBP1Q12365 YOL085CYOL085C 342 nt13.04□□□□□ -0.32
BBP1Q12365 SSA4YER103W 1929 nt12.98□□□□□ -0.33
BBP1Q12365 SPT5YML010W 3192 nt12.96□□□□□ -0.33
BBP1Q12365 RPP1BYDL130W 321 nt12.89□□□□□ -0.35
BBP1Q12365 CCC1YLR220W 969 nt12.88□□□□□ -0.35
BBP1Q12365 PKP1YIL042C 1185 nt12.83□□□□□ -0.36
BBP1Q12365 POA1YBR022W 534 nt12.74□□□□□ -0.37
BBP1Q12365 RVS167YDR388W 1449 nt12.72□□□□□ -0.37
BBP1Q12365 ARE1YCR048W 1833 nt12.71□□□□□ -0.38
BBP1Q12365 BSC6YOL137W 1494 nt12.67□□□□□ -0.38
BBP1Q12365 BDF1YLR399C 2061 nt12.63□□□□□ -0.39
BBP1Q12365 PAC11YDR488C 1602 nt12.59□□□□□ -0.39
BBP1Q12365 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.52□□□□□ -0.41
BBP1Q12365 SCJ1YMR214W 1134 nt12.47□□□□□ -0.41
BBP1Q12365 TAT1YBR069C 1860 nt12.42□□□□□ -0.42
BBP1Q12365 NVJ2YPR091C 2313 nt12.38□□□□□ -0.43
BBP1Q12365 SAH1YER043C 1350 nt12.33□□□□□ -0.44
BBP1Q12365 PET122YER153C 765 nt12.3□□□□□ -0.44
BBP1Q12365 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.28□□□□□ -0.44
BBP1Q12365 URN1YPR152C 1398 nt12.27□□□□□ -0.45
BBP1Q12365 SCR1SCR1 522 nt12.22□□□□□ -0.45
BBP1Q12365 ATS1YAL020C 1002 nt12.19□□□□□ -0.46
BBP1Q12365 SHR5YOL110W 714 nt12.18□□□□□ -0.46
BBP1Q12365 OPI9YLR338W 858 nt12.14□□□□□ -0.47
BBP1Q12365 BUD23YCR047C 828 nt12.12□□□□□ -0.47
BBP1Q12365 MEP2YNL142W 1500 nt12.01□□□□□ -0.49
BBP1Q12365 RRN5YLR141W 1092 nt11.92□□□□□ -0.5
BBP1Q12365 YDJ1YNL064C 1230 nt11.92□□□□□ -0.5
BBP1Q12365 FPS1YLL043W 2010 nt11.87□□□□□ -0.51
BBP1Q12365 DEP1YAL013W 1218 nt11.85□□□□□ -0.51
BBP1Q12365 RPN10YHR200W 807 nt11.83□□□□□ -0.52
BBP1Q12365 DCW1YKL046C 1350 nt11.81□□□□□ -0.52
BBP1Q12365 PTC2YER089C 1395 nt11.8□□□□□ -0.52
BBP1Q12365 NAB2YGL122C 1578 nt11.79□□□□□ -0.52
BBP1Q12365 YBR220CYBR220C 1683 nt11.78□□□□□ -0.52
BBP1Q12365 PUN1YLR414C 792 nt11.76□□□□□ -0.53
BBP1Q12365 YNL208WYNL208W 600 nt11.72□□□□□ -0.53
BBP1Q12365 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.69□□□□□ -0.54
BBP1Q12365 RSB1YOR049C 1065 nt11.69□□□□□ -0.54
BBP1Q12365 GAR1YHR089C 618 nt11.63□□□□□ -0.55
BBP1Q12365 PCH2YBR186W 1695 nt11.62□□□□□ -0.55
BBP1Q12365 GUT2YIL155C 1950 nt11.61□□□□□ -0.55
BBP1Q12365 EMI2YDR516C 1503 nt11.6□□□□□ -0.55
BBP1Q12365 FIS1YIL065C 468 nt11.56□□□□□ -0.56
BBP1Q12365 YMR090WYMR090W 684 nt11.56□□□□□ -0.56
BBP1Q12365 YPS1YLR120C 1710 nt11.51□□□□□ -0.57
BBP1Q12365 SDH1YKL148C 1923 nt11.5□□□□□ -0.57
BBP1Q12365 UME6YDR207C 2511 nt11.49□□□□□ -0.57
BBP1Q12365 SEC11YIR022W 504 nt11.47□□□□□ -0.57
BBP1Q12365 YJR018WYJR018W 363 nt11.46□□□□□ -0.57
BBP1Q12365 PIB2YGL023C 1908 nt11.44□□□□□ -0.58
BBP1Q12365 DAL1YIR027C 1383 nt11.43□□□□□ -0.58
BBP1Q12365 YDL221WYDL221W 552 nt11.43□□□□□ -0.58
BBP1Q12365 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.4□□□□□ -0.58
BBP1Q12365 FPR4YLR449W 1179 nt11.35□□□□□ -0.59
BBP1Q12365 PHO4YFR034C 939 nt11.34□□□□□ -0.59
BBP1Q12365 PST2YDR032C 597 nt11.29□□□□□ -0.6
BBP1Q12365 YDR095CYDR095C 411 nt11.26□□□□□ -0.61
BBP1Q12365 TIR1YER011W 765 nt11.26□□□□□ -0.61
BBP1Q12365 CAC2YML102W 1407 nt11.26□□□□□ -0.61
BBP1Q12365 SCC4YER147C 1875 nt11.25□□□□□ -0.61
BBP1Q12365 RTF1YGL244W 1677 nt11.21□□□□□ -0.61
BBP1Q12365 BOR1YNL275W 1731 nt11.21□□□□□ -0.62
BBP1Q12365 INM2YDR287W 879 nt11.18□□□□□ -0.62
BBP1Q12365 RPP2BYDR382W 333 nt11.18□□□□□ -0.62
BBP1Q12365 SSA1YAL005C 1929 nt11.16□□□□□ -0.62
BBP1Q12365 PTP1YDL230W 1008 nt11.16□□□□□ -0.62
BBP1Q12365 YJR120WYJR120W 351 nt11.16□□□□□ -0.62
BBP1Q12365 YSC84YHR016C 1407 nt11.14□□□□□ -0.63
BBP1Q12365 PTK1YKL198C 1989 nt11.1□□□□□ -0.63
BBP1Q12365 IRC15YPL017C 1500 nt11.09□□□□□ -0.63
BBP1Q12365 YHL050CYHL050C 2094 nt11.07□□□□□ -0.64
BBP1Q12365 GIS3YLR094C 1509 nt11.04□□□□□ -0.64
BBP1Q12365 RPP2AYOL039W 321 nt11.04□□□□□ -0.64
BBP1Q12365 MCH5YOR306C 1566 nt11.03□□□□□ -0.64
BBP1Q12365 BOP3YNL042W 1191 nt11.02□□□□□ -0.65
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