RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C YNR014WP53719 212 aa3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YNL165WP53891 406 aa3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YNL140CP53910 189 aa3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C TGL2P54857 326 aa3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YMR082CQ04276 118 aa3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C GRH1Q04410 372 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C GAS5Q08193 484 aa3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C GRE1Q08969 168 aa3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YRA1Q12159 226 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C MCT1Q12283 360 aa3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C POM34Q12445 299 aa3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YLR149CQ99296 730 aa3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C ATG40Q99325 256 aa3.07□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C FMP49A0A023PZB3 126 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C VAR1P02381 398 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C RPL7AP05737 244 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C RAD6P06104 172 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C CYC3P06182 269 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C POX1P13711 748 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C CWP1P28319 239 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C HOG1P32485 435 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C MKK1P32490 508 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C GPX1P36014 167 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C CBP4P37267 147 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C MRPL16P38064 232 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C FLO5P38894 1075 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C EAF5P39995 279 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YER134CP40081 178 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YJL213WP40896 331 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YCH1P42937 148 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C SNO3P43544 222 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C SFH5P47008 294 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YJL007CP47080 104 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YJR115WP47152 169 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YDL186WP48568 277 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YNR064CP53750 290 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C SNO2P53823 222 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C UBC7Q02159 165 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C ARR3Q06598 404 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C NDD1Q08887 554 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C FCY22Q12119 530 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C PEX11Q12462 236 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C ODC2Q99297 307 aa3.06□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C HEM4P06174 275 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C INO4P13902 151 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C KRE1P17260 313 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C IDH2P28241 369 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YKL071WP36086 256 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C RPL14AP36105 138 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YKR070WP36151 352 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YBR090CP38253 122 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C TEM1P38987 245 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C OXA1P39952 402 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YND1P40009 630 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C ATF1P40353 525 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YJL068CP40363 299 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YIL169CP40442 995 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C AZF1P41696 914 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YFL065CP43539 102 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YFL054CP43549 646 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C GPI2P46961 280 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YJR124CP47159 448 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C COQ5P49017 307 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YIP3P53633 176 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C DAD3P69850 94 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C RIM9Q04734 239 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C RSF1Q05043 376 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YLR296WQ05898 108 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C NMA1Q06178 401 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YFH1Q07540 174 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C ENV9Q08651 330 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YPR203WQ08994 102 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C SME1Q12330 94 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YOS1Q3E834 85 aa3.05□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C FLO9P39712 1322 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C STE7P06784 515 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C MRS1P07266 363 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YKR104WP0CE69 306 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C RPL12BP0CX54 165 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C MSI1P13712 422 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C MDH2P22133 377 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C ERG8P24521 451 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C PCL1P24867 279 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YGL010WP25338 174 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C AHT1P29589 182 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C ECM15P35195 104 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C UBS1P38290 277 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C ATX1P38636 73 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YHR097CP38809 366 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C YER076CP40049 302 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C RPL34BP40525 121 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C JJJ3P47138 172 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C VPS25P47142 202 aa3.04□□□□□ -1.92
SPT4YGR063C BXI1P48558 297 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 95.2 ms