RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W CDC43P18898 376 aa4.52□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W MTL1P53214 551 aa4.52□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W GEP3Q08622 556 aa4.52□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YLR302CO13544 120 aa4.52□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W VRP1P37370 817 aa4.52□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W XBP1P40489 647 aa4.52□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W PAM16P42949 149 aa4.52□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W LCB3P47013 409 aa4.52□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YCR007CP25354 239 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W NUD1P32336 851 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W TEM1P38987 245 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W PFS2P42841 465 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data4.51□□□□□ -1.69not detected
CYK3YDL117W MMS2P53152 137 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YGR039WP53225 103 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W BUD9P53226 547 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W MHF2Q3E829 80 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W MOT1P32333 1867 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YEL076C-AP0CX16 216 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YLR464WP0CX17 216 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W RPB8P20436 146 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YCR100CP25606 316 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W SKN1P33336 771 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W ATG12P38316 186 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YEL076CP39971 216 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W GLE2P40066 365 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W APQ12P40532 138 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W PAU5P43575 122 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W GON7P46984 123 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W ERG13P54839 491 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YMR166CQ03829 368 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W RIF1P29539 1916 aa4.51□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W HTA1P04911 132 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W SAM35P14693 329 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W CMC1P36064 111 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YBR063CP38083 404 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W HTD2P38790 280 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W RPN11P43588 306 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W PRM8P53174 237 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W TRI1Q05024 226 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W ERG8P24521 451 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YPS1P32329 569 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W CDC5P32562 705 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W ASC1P38011 319 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W ATX1P38636 73 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W NDT80P38830 627 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W HMS2P47175 358 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W EST3Q03096 181 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W BET5Q03630 159 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YLR042CQ07990 161 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W PRS5Q12265 496 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YPL229WQ99395 206 aa4.5□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W ATS1P31386 333 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W VMA11P32842 164 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YKL102CP34249 101 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W DLS1P40366 167 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YFR045WP43617 309 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YIP5P53108 310 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W NCE103P53615 221 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YNR071CP53757 342 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W COF1Q03048 143 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W ELO1P39540 310 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W CWP2P43497 92 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YMR082CQ04276 118 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YDR344CQ05510 147 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W UPS1Q05776 175 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W KEI1Q06346 221 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W HRT1Q08273 121 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YDR029WQ12111 104 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W COX19Q3E731 98 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W KTI11Q3E840 82 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W SOD2P00447 233 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W SRP21P32342 167 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W PAU16P35994 123 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YIR007WP40566 764 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W NAT3Q06504 195 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W ATG41Q12048 136 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W JID1Q12350 301 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W Q0182Q9ZZW1 134 aa4.49□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W SPO73P40031 143 aa4.48□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W HPF1Q05164 967 aa4.48□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W ARR3Q06598 404 aa4.48□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YOL024WQ08172 172 aa4.48□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YLR363W-AQ3E747 85 aa4.48□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YRF1-3P0CX14 1859 aa4.48□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YRF1-7P0CX15 1859 aa4.48□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YRF1-6P53819 1859 aa4.48□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W POR1P04840 283 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W MSI1P13712 422 aa4.48□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W IST3P40565 148 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YGL262WP53054 175 aa4.48□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W BRR6P53062 197 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 74.4 ms