RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C PRM8P53174 237 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C PDR17P53844 350 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C HRI1Q05905 244 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C YPR098CQ06089 161 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C TAZ1Q06510 381 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C SWC7Q06707 132 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C PRM3Q08931 133 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C PFA4Q12006 378 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C YDL157CQ12082 118 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C YRF1-3P0CX14 1859 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C YRF1-7P0CX15 1859 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C YRF1-6P53819 1859 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C VPS63O13549 108 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C CDC21P06785 304 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data2.79□□□□□ -1.96not detected
DOA4YDR069C LRE1P25579 583 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C FEN2P25621 512 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C TIP1P27654 210 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C NTH1P32356 751 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C ADH5P38113 351 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C SPL2P38839 148 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C ERG28P40030 148 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C AIM11P87275 137 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C UTP15Q04305 513 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C YOR385WQ08909 290 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C PRS5Q12265 496 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C RAX2Q12465 1220 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C KTI11Q3E840 82 aa2.79□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C HIP1P06775 603 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C RPB8P20436 146 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C OAC1P32332 324 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C SOR1P35497 357 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C FRM2P37261 193 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C LSM2P38203 95 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C NSA2P40078 261 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C LTP1P40347 161 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C XPT1P47165 209 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C TTI2P47168 421 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C YGL262WP53054 175 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C RMD9P53140 646 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C RHO4Q00246 291 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C EST3Q03096 181 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C STP4Q07351 490 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C SOR2Q07786 357 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C HSP33Q08914 237 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C MCT1Q12283 360 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C MSI1P13712 422 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C GLN3P18494 730 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C CDC43P18898 376 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C GLC7P32598 312 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C SGE1P33335 543 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C TRR2P38816 342 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C UME6P39001 836 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C PSD1P39006 500 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C CDC40P40968 455 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C BUD8P41698 603 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C POP1P41812 875 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C PFS2P42841 465 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C CIN2P46670 268 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C YGR149WP48236 432 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C BNS1P50084 137 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C MTM1P53320 366 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C AIM33Q04516 312 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C DIC1Q06143 298 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C CSI2Q08054 341 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C YLR412C-AQ3E742 68 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C HKR1P41809 1802 aa2.78□□□□□ -1.96
DOA4YDR069C UBC5P15732 148 aa2.78□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C KRE1P17260 313 aa2.78□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C TKL1P23254 680 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YMC2P38087 329 aa2.78□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C MIC12P38341 106 aa2.78□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C ATG27P46989 271 aa2.78□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C CRZ1P53968 678 aa2.78□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C TIM8P57744 87 aa2.78□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C RCR2Q03446 210 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C ATG41Q12048 136 aa2.78□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YER039C-AP0CD97 72 aa2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YCL068CP25593 260 aa2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YCR090CP25654 182 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C HXT4P32467 576 aa2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C ASC1P38011 319 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C RPS20P38701 121 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C HTD2P38790 280 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YNL194CP40169 301 aa2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C MPM1P40364 252 aa2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C APQ12P40532 138 aa2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YGL230CP53074 147 aa2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YGR250CP53316 781 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C EFM6P53970 246 aa2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C LSM3P57743 89 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YML079WQ03629 201 aa2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YMR030W-AQ3E760 96 aa2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C RIP1P08067 215 aa2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.1 ms