RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	FMP48	P53233	369 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	CRZ1	P53968	678 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YCT1	Q12235	531 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	BBP1	Q12365	385 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	MSI1	P13712	422 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	LAC1	P28496	418 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	OCH1	P31755	480 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RNP1	P32385	249 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	VAM7	P32912	316 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	POP8	P38208	133 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YHL044W	P38727	235 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	BLM10	P43583	2143 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	OKP1	P53298	406 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	BUD25	P85052	153 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YMR279C	Q03263	540 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RTT103	Q05543	409 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SOR2	Q07786	357 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	HRD1	Q08109	551 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	FEX1	Q08913	375 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	FCY22	Q12119	530 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YLR108C	Q12259	485 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	MNS1	P32906	549 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	RPB7	P34087	171 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	ERV15	P38312	142 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	SHG1	P38337	142 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.83	□□□□□ -1.8	not detected
CPR4	YCR069W	ABM1	P47146	123 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	SBH2	P52871	88 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	GEP7	P53171	287 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	PAM18	Q07914	168 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	EAF3	Q12432	401 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	IRA1	P18963	3092 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	IRA2	P19158	3079 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YCR043C	P25361	127 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	IMP1	P28627	190 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	SPS18	P32572	300 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	ECM31	P38122	312 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	COS8	P38723	381 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	RMD6	P39975	231 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	PHM8	P40025	321 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	SYG1	P40528	902 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YFL051C	P43552	160 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	THI74	Q04083	370 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	ARR2	Q06597	130 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YOR292C	Q08743	309 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	FEX2	Q08991	375 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	AEP3	Q12089	606 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	ATG31	Q12421	196 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YMR31	P19955	123 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	PCL1	P24867	279 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	LSB5	P25369	354 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	GPI18	P38211	433 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	BNA1	P47096	177 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	TTI2	P47168	421 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	UBC12	P52491	188 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	GPI15	P53961	229 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	SKO1	Q02100	647 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YPL077C	Q02831	240 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	PLP1	Q04004	230 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	FIT1	Q04433	528 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	ANT1	Q06497	328 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	FRE8	Q12209	686 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	VPS63	O13549	108 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	RPL43B	P0CX26	92 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	SEN2	P16658	377 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	ATP10	P18496	279 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	DAL80	P26343	269 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	ECM25	P32525	599 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	PDC2	P32896	925 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	SLM6	P38343	150 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	VMA22	P38784	181 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	GEP4	P38812	185 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	IKI1	P38874	309 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YER121W	P40076	114 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YIR035C	P40579	254 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YGR210C	P42942	411 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	GON7	P46984	123 aa		3.8	□□□□□ -1.8

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