RNA–Protein interactions for RNA: YMR304W

UBP15, Transcript of Ubiquitin-specific protease involved in protein deubiquitination, yeast

Gene UBP15, Length 3,693 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBP15	YMR304W	BNI4	P53858	892 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	ERT1	P38140	529 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	YIR014W	P40570	242 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	YFL040W	P43562	540 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	ISU2	Q12056	156 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	XDJ1	P39102	459 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	NYV1	Q12255	253 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	RIM15	P43565	1770 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	RAD16	P31244	790 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	IES2	P40154	320 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	SCT1	P32784	759 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	YRF1-6	P53819	1859 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	SAP190	P36123	1033 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	ENV11	P53246	860 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	AIM21	P40563	679 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	AIM44	Q99299	758 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	RAD4	P14736	754 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	RAV1	P47104	1357 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	BUG1	Q12191	341 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	FIG2	P25653	1609 aa		3.15	□□□□□ -1.9
UBP15	YMR304W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	DOT5	P40553	215 aa		3.15	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	FMP30	Q02883	468 aa		3.15	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	YDR090C	Q03193	310 aa		3.15	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	BRL1	P38770	471 aa		3.15	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	GYP1	Q08484	637 aa		3.15	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	PDR1	P12383	1068 aa		3.14	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	YRR1	Q12172	810 aa		3.14	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	CLA4	P48562	842 aa		3.14	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	MEC3	Q02574	474 aa		3.14	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	MAL31	P38156	614 aa		3.14	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	TOS1	P38288	455 aa		3.14	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	ORM2	Q06144	216 aa		3.14	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	DLD1	P32891	587 aa		3.13	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	SIC1	P38634	284 aa		3.13	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	RIA1	P53893	1110 aa		3.13	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	SIR4	P11978	1358 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	YIL177C	P40434	1758 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	YJL225C	P40889	1758 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	SPC110	P32380	944 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	CKB1	P43639	278 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	YPR015C	Q12531	247 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	TY4B-J	P47024	1803 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	SHC1	P39000	512 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	COX6	P00427	148 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	PBS2	P08018	668 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	NPL4	P33755	580 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	ZDS2	P54786	942 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	CSC1	Q06538	782 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	VPS72	Q03388	795 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	TLG1	Q03322	224 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	TCB1	Q12466	1186 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	TFB4	Q12004	338 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	MSN5	P52918	1224 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	PFF1	P38244	976 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	YML133C	Q03099	1374 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	NUD1	P32336	851 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	YKR075C	P36155	307 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	PEA2	P40091	420 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	HVG1	P0CE11	249 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	RAM1	P22007	431 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
UBP15	YMR304W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
UBP15	YMR304W	ORC6	P38826	435 aa		3.09	□□□□□ -1.92
UBP15	YMR304W	KRE5	P22023	1365 aa		3.09	□□□□□ -1.92
UBP15	YMR304W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
UBP15	YMR304W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
UBP15	YMR304W	MAM3	Q12296	706 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP15	YMR304W	GRX6	Q12438	231 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP15	YMR304W	CLN1	P20437	546 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP15	YMR304W	MSC7	P38694	644 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP15	YMR304W	YIL089W	P40500	205 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP15	YMR304W	YPR109W	Q06104	294 aa		3.08	□□□□□ -1.92

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