RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613358.4

PGRMC2-208, Transcript of progesterone receptor membrane component 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC2, Length 3,783 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC2-208ENST00000613358 PBRM1Q86U86 1689 aa22.43■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.43■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.43■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.43■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.43■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.42■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 TSPY4P0CV99 314 aa22.42■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 TSPY10P0CW01 314 aa22.42■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.42■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 SAMD9Q5K651 1589 aa22.42■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.42■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.42■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.41■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.41■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.4■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 PTPRGP23470 1445 aa22.39■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 E9PSI1 815 aa22.38■■□□□ 1.17
PGRMC2-208ENST00000613358 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.38■■□□□ 1.17
PGRMC2-208ENST00000613358 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PGRMC2-208ENST00000613358 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.35■■□□□ 1.17
PGRMC2-208ENST00000613358 PDE3AQ14432 1141 aa22.35■■□□□ 1.17
PGRMC2-208ENST00000613358 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.35■■□□□ 1.17
PGRMC2-208ENST00000613358 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PGRMC2-208ENST00000613358 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PGRMC2-208ENST00000613358 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.34■■□□□ 1.17
PGRMC2-208ENST00000613358 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.34■■□□□ 1.17
PGRMC2-208ENST00000613358 ZNF521Q96K83 1311 aa22.33■■□□□ 1.17
PGRMC2-208ENST00000613358 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PGRMC2-208ENST00000613358 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 TNNQ9UQP3 1299 aa22.33■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 TESK2Q96S53 571 aa22.32■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 GBP4Q96PP9 640 aa22.31■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 ERBINQ96RT1 1412 aa22.29■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 INSRP06213 1382 aa22.28■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.27■■□□□ 1.16
PGRMC2-208ENST00000613358 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.26■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 DISP1Q96F81 1524 aa22.25■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 RLBP1P12271 317 aa22.25■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.25■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.24■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 NLRP1Q9C000 1473 aa22.24■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.23■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.22■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.22■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.22■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.21■■□□□ 1.15
PGRMC2-208ENST00000613358 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 E9PCH4 1651 aa22.2■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 KIAA0556O60303 1618 aa22.2■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 OFD1O75665 1012 aa22.18■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 WWC1Q8IX03 1113 aa22.18■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 RIPK4P57078 832 aa22.16■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.16■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 UQCRHP07919 91 aa22.16■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 CEP170Q5SW79 1584 aa22.16■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 NUP160Q12769 1436 aa22.15■■□□□ 1.14
PGRMC2-208ENST00000613358 CDCA8Q53HL2 280 aa22.13■■□□□ 1.13
PGRMC2-208ENST00000613358 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.12■■□□□ 1.13
PGRMC2-208ENST00000613358 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.12■■□□□ 1.13
PGRMC2-208ENST00000613358 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.11■■□□□ 1.13
PGRMC2-208ENST00000613358 MAP7D2Q96T17 732 aa22.11■■□□□ 1.13
PGRMC2-208ENST00000613358 SSFA2P28290 1259 aa22.11■■□□□ 1.13
PGRMC2-208ENST00000613358 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PGRMC2-208ENST00000613358 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.11■■□□□ 1.13
PGRMC2-208ENST00000613358 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.1■■□□□ 1.13
PGRMC2-208ENST00000613358 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.1■■□□□ 1.13
PGRMC2-208ENST00000613358 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PGRMC2-208ENST00000613358 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PGRMC2-208ENST00000613358 LNPKQ9C0E8 428 aa22.08■■□□□ 1.13
PGRMC2-208ENST00000613358 PTMSP20962 102 aa22.08■■□□□ 1.12
PGRMC2-208ENST00000613358 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.07■■□□□ 1.12
PGRMC2-208ENST00000613358 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PGRMC2-208ENST00000613358 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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