RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.67■■□□□ 1.7
CCNDBP1-204ENST00000563065 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZFYVE9O95405 1425 aa25.67■■□□□ 1.7
CCNDBP1-204ENST00000563065 MED14O60244 1454 aa25.65■■□□□ 1.7
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF1BO60333 1816 aa25.64■■□□□ 1.69
CCNDBP1-204ENST00000563065 RGL3Q3MIN7 710 aa25.62■■□□□ 1.69
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CCNDBP1-204ENST00000563065 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CCNDBP1-204ENST00000563065 IQGAP1P46940 1657 aa25.6■■□□□ 1.69
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
CCNDBP1-204ENST00000563065 BCANQ96GW7 911 aa25.6■■□□□ 1.69
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.58■■□□□ 1.69
CCNDBP1-204ENST00000563065 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.57■■□□□ 1.68
CCNDBP1-204ENST00000563065 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.55■■□□□ 1.68
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.55■■□□□ 1.68
CCNDBP1-204ENST00000563065 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.51■■□□□ 1.67
CCNDBP1-204ENST00000563065 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.48■■□□□ 1.67
CCNDBP1-204ENST00000563065 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CCNDBP1-204ENST00000563065 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.47■■□□□ 1.67
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPLO60437 1756 aa25.45■■□□□ 1.66
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBX22Q9Y458 520 aa25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-204ENST00000563065 NEUROD1Q13562 356 aa25.42■■□□□ 1.66
CCNDBP1-204ENST00000563065 CERKQ8TCT0 537 aa25.42■■□□□ 1.66
CCNDBP1-204ENST00000563065 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-204ENST00000563065 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-204ENST00000563065 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1-204ENST00000563065 IFT172Q9UG01 1749 aa25.39■■□□□ 1.66
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.39■■□□□ 1.65
CCNDBP1-204ENST00000563065 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.39■■□□□ 1.65
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCNA6P17658 529 aa25.38■■□□□ 1.65
CCNDBP1-204ENST00000563065 METP08581 1390 aa25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-204ENST00000563065 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTPRUQ92729 1446 aa25.33■■□□□ 1.65
CCNDBP1-204ENST00000563065 DIP2AQ14689 1571 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 ALKQ9UM73 1620 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 CPS1P31327 1500 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.31■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIK3C2GO75747 1445 aa25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYOM2P54296 1465 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIK3R4Q99570 1358 aa25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 NWD1Q149M9 1564 aa25.26■■□□□ 1.63
CCNDBP1-204ENST00000563065 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM94Q12767 1356 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-204ENST00000563065 STAC3Q96MF2 364 aa25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1-204ENST00000563065 STK26Q9P289 416 aa25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1-204ENST00000563065 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CCNDBP1-204ENST00000563065 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-204ENST00000563065 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-204ENST00000563065 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-204ENST00000563065 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1-204ENST00000563065 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.15■■□□□ 1.62
CCNDBP1-204ENST00000563065 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.15■■□□□ 1.62
CCNDBP1-204ENST00000563065 TONSLQ96HA7 1378 aa25.14■■□□□ 1.62
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.14■■□□□ 1.62
CCNDBP1-204ENST00000563065 FBXO41Q8TF61 875 aa25.14■■□□□ 1.61
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CCNDBP1-204ENST00000563065 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CCNDBP1-204ENST00000563065 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.12■■□□□ 1.61
CCNDBP1-204ENST00000563065 C14orf37Q86TY3 774 aa25.12■■□□□ 1.61
CCNDBP1-204ENST00000563065 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.1■■□□□ 1.61
CCNDBP1-204ENST00000563065 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.1■■□□□ 1.61
CCNDBP1-204ENST00000563065 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CCNDBP1-204ENST00000563065 LAMC1P11047 1609 aa25.1■■□□□ 1.61
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.1■■□□□ 1.61
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADGRB1O14514 1584 aa25.09■■□□□ 1.61
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCC11Q96J66 1382 aa25.09■■□□□ 1.61
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.08■■□□□ 1.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTCH1Q13635 1447 aa25.07■■□□□ 1.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 TOM1O60784 492 aa25.07■■□□□ 1.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIP4K2BP78356 416 aa25.07■■□□□ 1.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 MSH6P52701 1360 aa25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 TECPR2O15040 1411 aa25.05■■□□□ 1.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.05■■□□□ 1.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.04■■□□□ 1.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRAM1Q96QH2 718 aa25.02■■□□□ 1.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-204ENST00000563065 KNDC1Q76NI1 1749 aa25■■□□□ 1.59
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25■■□□□ 1.59
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATF3P18847 181 aa24.99■■□□□ 1.59
CCNDBP1-204ENST00000563065 SIRT1Q96EB6 747 aa24.99■■□□□ 1.59
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1-204ENST00000563065 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1-204ENST00000563065 POGKQ9P215 609 aa24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLAIN2Q9P270 581 aa24.97■■□□□ 1.59
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