RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 FOXD1Q16676 465 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-208ENST00000528920 KIF1BO60333 1816 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-208ENST00000528920 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-208ENST00000528920 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-208ENST00000528920 LTKP29376 864 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-208ENST00000528920 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-208ENST00000528920 IQGAP1P46940 1657 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-208ENST00000528920 EID1Q9Y6B2 187 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-208ENST00000528920 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-208ENST00000528920 ZFYVE9O95405 1425 aa21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-208ENST00000528920 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-208ENST00000528920 PIP4K2BP78356 416 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-208ENST00000528920 CPS1P31327 1500 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-208ENST00000528920 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-208ENST00000528920 TOM1O60784 492 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-208ENST00000528920 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-208ENST00000528920 HSPA1LP34931 641 aa21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TSTA3-208ENST00000528920 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-208ENST00000528920 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-208ENST00000528920 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-208ENST00000528920 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-208ENST00000528920 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-208ENST00000528920 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-208ENST00000528920 PPLO60437 1756 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-208ENST00000528920 BCANQ96GW7 911 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-208ENST00000528920 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-208ENST00000528920 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-208ENST00000528920 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-208ENST00000528920 IFT172Q9UG01 1749 aa21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-208ENST00000528920 DIP2AQ14689 1571 aa21.45■■□□□ 1.02
TSTA3-208ENST00000528920 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.45■■□□□ 1.02
TSTA3-208ENST00000528920 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TSTA3-208ENST00000528920 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.45■■□□□ 1.02
TSTA3-208ENST00000528920 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-208ENST00000528920 TBX22Q9Y458 520 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-208ENST00000528920 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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TSTA3-208ENST00000528920 RGL3Q3MIN7 710 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-208ENST00000528920 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-208ENST00000528920 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-208ENST00000528920 ALKQ9UM73 1620 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-208ENST00000528920 NWD1Q149M9 1564 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-208ENST00000528920 KCNA6P17658 529 aa21.39■■□□□ 1.01
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TSTA3-208ENST00000528920 PIK3R4Q99570 1358 aa21.37■■□□□ 1.01
TSTA3-208ENST00000528920 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
TSTA3-208ENST00000528920 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TSTA3-208ENST00000528920 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.34■■□□□ 1.01
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TSTA3-208ENST00000528920 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.34■■□□□ 1.01
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TSTA3-208ENST00000528920 MYOM2P54296 1465 aa21.32■■□□□ 1
TSTA3-208ENST00000528920 METP08581 1390 aa21.31■■□□□ 1
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TSTA3-208ENST00000528920 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.26■□□□□ 0.99
TSTA3-208ENST00000528920 STAC3Q96MF2 364 aa21.26■□□□□ 0.99
TSTA3-208ENST00000528920 LAMC1P11047 1609 aa21.25■□□□□ 0.99
TSTA3-208ENST00000528920 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.24■□□□□ 0.99
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TSTA3-208ENST00000528920 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.22■□□□□ 0.99
TSTA3-208ENST00000528920 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.21■□□□□ 0.99
TSTA3-208ENST00000528920 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
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TSTA3-208ENST00000528920 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.21■□□□□ 0.99
TSTA3-208ENST00000528920 NEUROD1Q13562 356 aa21.19■□□□□ 0.98
TSTA3-208ENST00000528920 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.18■□□□□ 0.98
TSTA3-208ENST00000528920 PTCH1Q13635 1447 aa21.17■□□□□ 0.98
TSTA3-208ENST00000528920 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.16■□□□□ 0.98
TSTA3-208ENST00000528920 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.16■□□□□ 0.98
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TSTA3-208ENST00000528920 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.16■□□□□ 0.98
TSTA3-208ENST00000528920 MSH6P52701 1360 aa21.15■□□□□ 0.98
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TSTA3-208ENST00000528920 ABCC11Q96J66 1382 aa21.13■□□□□ 0.97
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TSTA3-208ENST00000528920 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.12■□□□□ 0.97
TSTA3-208ENST00000528920 C14orf37Q86TY3 774 aa21.12■□□□□ 0.97
TSTA3-208ENST00000528920 STK26Q9P289 416 aa21.12■□□□□ 0.97
TSTA3-208ENST00000528920 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
TSTA3-208ENST00000528920 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.11■□□□□ 0.97
TSTA3-208ENST00000528920 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.11■□□□□ 0.97
TSTA3-208ENST00000528920 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.09■□□□□ 0.97
TSTA3-208ENST00000528920 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.08■□□□□ 0.96
TSTA3-208ENST00000528920 DCCP43146 1447 aa21.07■□□□□ 0.96
TSTA3-208ENST00000528920 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.06■□□□□ 0.96
TSTA3-208ENST00000528920 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.06■□□□□ 0.96
TSTA3-208ENST00000528920 SIRT1Q96EB6 747 aa21.06■□□□□ 0.96
TSTA3-208ENST00000528920 TONSLQ96HA7 1378 aa21.06■□□□□ 0.96
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