RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 IQGAP2Q13576 1575 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 SOX12O15370 315 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 OFD1O75665 1012 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 RALBP1Q15311 655 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 PKD2Q13563 968 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 USP47Q96K76 1375 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 CRBNQ96SW2 442 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 ERCC6Q03468 1493 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 ZBTB9Q96C00 473 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 FBXO3Q9UK99 471 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.031e-7■■□□□ 13.6
SH3BP2-217ENST00000510204 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 MRE11P49959 708 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 JPH4Q96JJ6 628 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 PLIN1O60240 522 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 UQCRHP07919 91 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 SKAP1Q86WV1 359 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 DAPK1P53355 1430 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 RGL3Q3MIN7 710 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 CBX1P83916 185 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 SLC20A2Q08357 652 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 ABCC5O15440 1437 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 NLRP13Q86W25 1043 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 BECN1Q14457 450 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 PRR29P0C7W0 189 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 C8orf34Q49A92 452 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 PBRM1Q86U86 1689 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 TSPY4P0CV99 314 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 TSPY10P0CW01 314 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 DYNC1I1O14576 645 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 KCNJ4P48050 445 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 ADAMTS12P58397 1594 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 TICAM2Q86XR7 235 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 WDR62O43379 1518 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 NUP155O75694 1391 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 ARHGEF11O15085 1522 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 IGSF3O75054 1194 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 ROCK1Q13464 1354 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 DISP1Q96F81 1524 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 IFT140Q96RY7 1462 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 KDM5CP41229 1560 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 PTMSP20962 102 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 GRIN2AQ12879 1464 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 KIF14Q15058 1648 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 MBD5Q9P267 1494 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 INSRP06213 1382 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 CFAP44Q96MT7 982 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 ATP2B3Q16720 1220 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 MLECQ14165 292 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.73□□□□□ -0.05
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