RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 IQGAP1P46940 1657 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRB3O60242 1522 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC52A1Q9NWF4 448 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM2Q9UHN6 1383 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM52Q96A61 297 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 CLTCL1P53675 1640 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO41Q8TF61 875 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFYVE9O95405 1425 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF1BO60333 1816 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 SETD5Q9C0A6 1442 aa10.53□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 RIMS2Q9UQ26 1411 aa10.53□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC26A8Q96RN1 970 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 EID1Q9Y6B2 187 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC4A2P04920 1241 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 MPHOSPH9Q99550 1183 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 TRPM2O94759 1503 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 ALKQ9UM73 1620 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 CPS1P31327 1500 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC7Q96NW7 1537 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 IQSEC2Q5JU85 1478 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 PPLO60437 1756 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-206ENST00000461017 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 NWD1Q149M9 1564 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPRUQ92729 1446 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 BCANQ96GW7 911 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 IFT172Q9UG01 1749 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 UBAP1LF5GYI3 381 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNA6P17658 529 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 TBX22Q9Y458 520 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 HDGFP51858 240 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 RGL3Q3MIN7 710 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 METP08581 1390 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 HRCP23327 699 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM94Q12767 1356 aa10.4□□□□□ -0.74
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RABGEF1-206ENST00000461017 DIP2AQ14689 1571 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 PIP4K2BP78356 416 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC144AA2RUR9 1427 aa10.4□□□□□ -0.75
RABGEF1-206ENST00000461017 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-206ENST00000461017 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-206ENST00000461017 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-206ENST00000461017 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-206ENST00000461017 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-206ENST00000461017 TOM1O60784 492 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-206ENST00000461017 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-206ENST00000461017 PIK3R4Q99570 1358 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-206ENST00000461017 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-206ENST00000461017 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPA1LP34931 641 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-206ENST00000461017 NALCNQ8IZF0 1738 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 PIK3C2GO75747 1445 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 NRXN1Q9ULB1 1477 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 ROBO2Q9HCK4 1378 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 MSH6P52701 1360 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 SIN3AQ96ST3 1273 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa10.3□□□□□ -0.76
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RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf44Q9H6X5 657 aa10.29□□□□□ -0.76
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLAIN2Q9P270 581 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM135BQ49AJ0 1406 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 MYOM2P54296 1465 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 STK26Q9P289 416 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-206ENST00000461017 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
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