RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 IQGAP1P46940 1657 aa31.37■■■□□ 2.61
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.36■■■□□ 2.61
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.36■■■□□ 2.61
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFYVE9O95405 1425 aa31.35■■■□□ 2.61
SH3BP4-204ENST00000416021 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
SH3BP4-204ENST00000416021 HRCP23327 699 aa31.29■■■□□ 2.6
SH3BP4-204ENST00000416021 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.29■■■□□ 2.6
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.29■■■□□ 2.6
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPM2O94759 1503 aa31.28■■■□□ 2.6
SH3BP4-204ENST00000416021 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.27■■■□□ 2.6
SH3BP4-204ENST00000416021 CPS1P31327 1500 aa31.26■■■□□ 2.59
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNA6P17658 529 aa31.23■■■□□ 2.59
SH3BP4-204ENST00000416021 TBX22Q9Y458 520 aa31.23■■■□□ 2.59
SH3BP4-204ENST00000416021 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.23■■■□□ 2.59
SH3BP4-204ENST00000416021 CLTCL1P53675 1640 aa31.21■■■□□ 2.59
SH3BP4-204ENST00000416021 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.21■■■□□ 2.59
SH3BP4-204ENST00000416021 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31.15■■■□□ 2.58
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.15■■■□□ 2.58
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.14■■■□□ 2.58
SH3BP4-204ENST00000416021 VGFO15240 615 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
SH3BP4-204ENST00000416021 TOM1O60784 492 aa31.12■■■□□ 2.57
SH3BP4-204ENST00000416021 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa31.12■■■□□ 2.57
SH3BP4-204ENST00000416021 STRCP1A6NGW2 1772 aa31.11■■■□□ 2.57
SH3BP4-204ENST00000416021 RGL3Q3MIN7 710 aa31.11■■■□□ 2.57
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF1BO60333 1816 aa31.05■■■□□ 2.56
SH3BP4-204ENST00000416021 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.04■■■□□ 2.56
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM94Q12767 1356 aa31.04■■■□□ 2.56
SH3BP4-204ENST00000416021 PIP4K2BP78356 416 aa31.03■■■□□ 2.56
SH3BP4-204ENST00000416021 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa31.03■■■□□ 2.56
SH3BP4-204ENST00000416021 PIK3R4Q99570 1358 aa31.03■■■□□ 2.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.01■■■□□ 2.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31■■■□□ 2.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
SH3BP4-204ENST00000416021 DIP2AQ14689 1571 aa30.96■■■□□ 2.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.96■■■□□ 2.55
SH3BP4-204ENST00000416021 METP08581 1390 aa30.96■■■□□ 2.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPRUQ92729 1446 aa30.95■■■□□ 2.54
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.95■■■□□ 2.54
SH3BP4-204ENST00000416021 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
SH3BP4-204ENST00000416021 NWD1Q149M9 1564 aa30.94■■■□□ 2.54
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
SH3BP4-204ENST00000416021 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
SH3BP4-204ENST00000416021 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.91■■■□□ 2.54
SH3BP4-204ENST00000416021 C14orf37Q86TY3 774 aa30.88■■■□□ 2.53
SH3BP4-204ENST00000416021 MSH6P52701 1360 aa30.86■■■□□ 2.53
SH3BP4-204ENST00000416021 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.86■■■□□ 2.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ALKQ9UM73 1620 aa30.84■■■□□ 2.53
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPA1LP34931 641 aa30.83■■■□□ 2.53
SH3BP4-204ENST00000416021 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.83■■■□□ 2.53
SH3BP4-204ENST00000416021 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
SH3BP4-204ENST00000416021 PPLO60437 1756 aa30.82■■■□□ 2.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SLAIN2Q9P270 581 aa30.79■■■□□ 2.52
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.78■■■□□ 2.52
SH3BP4-204ENST00000416021 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.77■■■□□ 2.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ATF3P18847 181 aa30.76■■■□□ 2.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.76■■■□□ 2.51
SH3BP4-204ENST00000416021 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.75■■■□□ 2.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PIK3C2GO75747 1445 aa30.73■■■□□ 2.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.73■■■□□ 2.51
SH3BP4-204ENST00000416021 STAC3Q96MF2 364 aa30.73■■■□□ 2.51
SH3BP4-204ENST00000416021 STK26Q9P289 416 aa30.73■■■□□ 2.51
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.73■■■□□ 2.51
SH3BP4-204ENST00000416021 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
SH3BP4-204ENST00000416021 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.7■■■□□ 2.51
SH3BP4-204ENST00000416021 IFT172Q9UG01 1749 aa30.68■■■□□ 2.5
SH3BP4-204ENST00000416021 MYOM2P54296 1465 aa30.68■■■□□ 2.5
SH3BP4-204ENST00000416021 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.68■■■□□ 2.5
SH3BP4-204ENST00000416021 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
SH3BP4-204ENST00000416021 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
SH3BP4-204ENST00000416021 PTCH1Q13635 1447 aa30.64■■■□□ 2.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCC11Q96J66 1382 aa30.64■■■□□ 2.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.63■■■□□ 2.49
SH3BP4-204ENST00000416021 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.62■■■□□ 2.49
SH3BP4-204ENST00000416021 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.61■■■□□ 2.49
SH3BP4-204ENST00000416021 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.59■■■□□ 2.49
SH3BP4-204ENST00000416021 NEUROD1Q13562 356 aa30.59■■■□□ 2.49
SH3BP4-204ENST00000416021 DCCP43146 1447 aa30.58■■■□□ 2.49
SH3BP4-204ENST00000416021 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
SH3BP4-204ENST00000416021 SIRT1Q96EB6 747 aa30.58■■■□□ 2.49
SH3BP4-204ENST00000416021 TECPR2O15040 1411 aa30.55■■■□□ 2.48
SH3BP4-204ENST00000416021 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.54■■■□□ 2.48
SH3BP4-204ENST00000416021 BRINP3Q76B58 766 aa30.53■■■□□ 2.48
SH3BP4-204ENST00000416021 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.52■■■□□ 2.48
SH3BP4-204ENST00000416021 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.52■■■□□ 2.48
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.51■■■□□ 2.47
SH3BP4-204ENST00000416021 MST1RQ04912 1400 aa30.5■■■□□ 2.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.49■■■□□ 2.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PRAM1Q96QH2 718 aa30.47■■■□□ 2.47
SH3BP4-204ENST00000416021 POGKQ9P215 609 aa30.46■■■□□ 2.47
SH3BP4-204ENST00000416021 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.45■■■□□ 2.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.44■■■□□ 2.46
SH3BP4-204ENST00000416021 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.44■■■□□ 2.46
SH3BP4-204ENST00000416021 LAMC1P11047 1609 aa30.44■■■□□ 2.46
SH3BP4-204ENST00000416021 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.42■■■□□ 2.46
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